Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Csnk1eQ9JMK2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Csnk1eQ9JMK2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csnk1eQ9JMK2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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