Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc2lQ9JME7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc2lQ9JME7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trappc2lQ9JME7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc2lQ9JME7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc2lQ9JME7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc2lQ9JME7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc2lQ9JME7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc2lQ9JME7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc2lQ9JME7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc2lQ9JME7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc2lQ9JME7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc2lQ9JME7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc2lQ9JME7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc2lQ9JME7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc2lQ9JME7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc2lQ9JME7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc2lQ9JME7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc2lQ9JME7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc2lQ9JME7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc2lQ9JME7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc2lQ9JME7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc2lQ9JME7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc2lQ9JME7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc2lQ9JME7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc2lQ9JME7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc2lQ9JME7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc2lQ9JME7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc2lQ9JME7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc2lQ9JME7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc2lQ9JME7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc2lQ9JME7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc2lQ9JME7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc2lQ9JME7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc2lQ9JME7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trappc2lQ9JME7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc2lQ9JME7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc2lQ9JME7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc2lQ9JME7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc2lQ9JME7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc2lQ9JME7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc2lQ9JME7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc2lQ9JME7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc2lQ9JME7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc2lQ9JME7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc2lQ9JME7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc2lQ9JME7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc2lQ9JME7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc2lQ9JME7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc2lQ9JME7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc2lQ9JME7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc2lQ9JME7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc2lQ9JME7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc2lQ9JME7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc2lQ9JME7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc2lQ9JME7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc2lQ9JME7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc2lQ9JME7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc2lQ9JME7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc2lQ9JME7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc2lQ9JME7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc2lQ9JME7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc2lQ9JME7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc2lQ9JME7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc2lQ9JME7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms