Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sfmbt1Q9JMD1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sfmbt1Q9JMD1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sfmbt1Q9JMD1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sfmbt1Q9JMD1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sfmbt1Q9JMD1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sfmbt1Q9JMD1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sfmbt1Q9JMD1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sfmbt1Q9JMD1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sfmbt1Q9JMD1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sfmbt1Q9JMD1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sfmbt1Q9JMD1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sfmbt1Q9JMD1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sfmbt1Q9JMD1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sfmbt1Q9JMD1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sfmbt1Q9JMD1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sfmbt1Q9JMD1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sfmbt1Q9JMD1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sfmbt1Q9JMD1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sfmbt1Q9JMD1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sfmbt1Q9JMD1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sfmbt1Q9JMD1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sfmbt1Q9JMD1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sfmbt1Q9JMD1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sfmbt1Q9JMD1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sfmbt1Q9JMD1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sfmbt1Q9JMD1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sfmbt1Q9JMD1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sfmbt1Q9JMD1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sfmbt1Q9JMD1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sfmbt1Q9JMD1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sfmbt1Q9JMD1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sfmbt1Q9JMD1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sfmbt1Q9JMD1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sfmbt1Q9JMD1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sfmbt1Q9JMD1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sfmbt1Q9JMD1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sfmbt1Q9JMD1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sfmbt1Q9JMD1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sfmbt1Q9JMD1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Sfmbt1Q9JMD1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sfmbt1Q9JMD1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sfmbt1Q9JMD1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sfmbt1Q9JMD1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sfmbt1Q9JMD1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sfmbt1Q9JMD1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sfmbt1Q9JMD1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sfmbt1Q9JMD1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sfmbt1Q9JMD1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sfmbt1Q9JMD1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sfmbt1Q9JMD1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sfmbt1Q9JMD1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sfmbt1Q9JMD1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sfmbt1Q9JMD1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sfmbt1Q9JMD1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sfmbt1Q9JMD1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sfmbt1Q9JMD1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sfmbt1Q9JMD1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sfmbt1Q9JMD1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sfmbt1Q9JMD1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sfmbt1Q9JMD1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sfmbt1Q9JMD1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sfmbt1Q9JMD1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sfmbt1Q9JMD1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sfmbt1Q9JMD1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sfmbt1Q9JMD1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sfmbt1Q9JMD1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sfmbt1Q9JMD1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sfmbt1Q9JMD1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sfmbt1Q9JMD1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sfmbt1Q9JMD1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sfmbt1Q9JMD1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sfmbt1Q9JMD1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sfmbt1Q9JMD1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sfmbt1Q9JMD1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sfmbt1Q9JMD1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sfmbt1Q9JMD1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sfmbt1Q9JMD1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sfmbt1Q9JMD1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sfmbt1Q9JMD1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sfmbt1Q9JMD1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sfmbt1Q9JMD1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sfmbt1Q9JMD1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sfmbt1Q9JMD1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms