Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLM8

Dclk1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk1Q9JLM8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dclk1Q9JLM8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dclk1Q9JLM8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dclk1Q9JLM8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dclk1Q9JLM8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dclk1Q9JLM8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dclk1Q9JLM8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Dclk1Q9JLM8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Dclk1Q9JLM8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dclk1Q9JLM8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dclk1Q9JLM8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dclk1Q9JLM8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dclk1Q9JLM8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dclk1Q9JLM8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dclk1Q9JLM8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dclk1Q9JLM8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dclk1Q9JLM8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dclk1Q9JLM8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dclk1Q9JLM8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dclk1Q9JLM8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dclk1Q9JLM8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Dclk1Q9JLM8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dclk1Q9JLM8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dclk1Q9JLM8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dclk1Q9JLM8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dclk1Q9JLM8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dclk1Q9JLM8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dclk1Q9JLM8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Dclk1Q9JLM8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dclk1Q9JLM8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dclk1Q9JLM8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dclk1Q9JLM8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dclk1Q9JLM8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dclk1Q9JLM8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Dclk1Q9JLM8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dclk1Q9JLM8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dclk1Q9JLM8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dclk1Q9JLM8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dclk1Q9JLM8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dclk1Q9JLM8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dclk1Q9JLM8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dclk1Q9JLM8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dclk1Q9JLM8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dclk1Q9JLM8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dclk1Q9JLM8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dclk1Q9JLM8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Dclk1Q9JLM8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dclk1Q9JLM8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dclk1Q9JLM8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dclk1Q9JLM8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dclk1Q9JLM8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dclk1Q9JLM8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dclk1Q9JLM8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Dclk1Q9JLM8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dclk1Q9JLM8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dclk1Q9JLM8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dclk1Q9JLM8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dclk1Q9JLM8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Dclk1Q9JLM8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dclk1Q9JLM8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dclk1Q9JLM8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dclk1Q9JLM8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dclk1Q9JLM8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dclk1Q9JLM8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dclk1Q9JLM8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dclk1Q9JLM8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dclk1Q9JLM8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dclk1Q9JLM8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dclk1Q9JLM8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dclk1Q9JLM8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dclk1Q9JLM8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dclk1Q9JLM8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dclk1Q9JLM8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dclk1Q9JLM8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dclk1Q9JLM8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dclk1Q9JLM8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dclk1Q9JLM8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dclk1Q9JLM8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dclk1Q9JLM8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dclk1Q9JLM8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dclk1Q9JLM8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dclk1Q9JLM8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dclk1Q9JLM8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dclk1Q9JLM8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dclk1Q9JLM8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dclk1Q9JLM8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dclk1Q9JLM8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dclk1Q9JLM8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dclk1Q9JLM8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dclk1Q9JLM8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dclk1Q9JLM8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dclk1Q9JLM8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dclk1Q9JLM8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dclk1Q9JLM8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dclk1Q9JLM8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dclk1Q9JLM8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dclk1Q9JLM8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dclk1Q9JLM8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dclk1Q9JLM8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dclk1Q9JLM8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms