Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col5a3Q9JLI2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col5a3Q9JLI2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col5a3Q9JLI2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col5a3Q9JLI2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col5a3Q9JLI2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Col5a3Q9JLI2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Col5a3Q9JLI2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col5a3Q9JLI2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col5a3Q9JLI2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col5a3Q9JLI2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col5a3Q9JLI2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col5a3Q9JLI2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col5a3Q9JLI2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col5a3Q9JLI2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col5a3Q9JLI2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col5a3Q9JLI2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col5a3Q9JLI2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col5a3Q9JLI2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col5a3Q9JLI2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Col5a3Q9JLI2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col5a3Q9JLI2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col5a3Q9JLI2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col5a3Q9JLI2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col5a3Q9JLI2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col5a3Q9JLI2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col5a3Q9JLI2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col5a3Q9JLI2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col5a3Q9JLI2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Col5a3Q9JLI2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Col5a3Q9JLI2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col5a3Q9JLI2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col5a3Q9JLI2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col5a3Q9JLI2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col5a3Q9JLI2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col5a3Q9JLI2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col5a3Q9JLI2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col5a3Q9JLI2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col5a3Q9JLI2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col5a3Q9JLI2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Col5a3Q9JLI2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col5a3Q9JLI2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col5a3Q9JLI2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col5a3Q9JLI2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col5a3Q9JLI2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col5a3Q9JLI2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col5a3Q9JLI2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col5a3Q9JLI2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col5a3Q9JLI2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col5a3Q9JLI2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col5a3Q9JLI2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col5a3Q9JLI2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col5a3Q9JLI2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col5a3Q9JLI2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col5a3Q9JLI2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col5a3Q9JLI2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col5a3Q9JLI2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col5a3Q9JLI2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col5a3Q9JLI2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col5a3Q9JLI2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col5a3Q9JLI2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col5a3Q9JLI2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col5a3Q9JLI2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col5a3Q9JLI2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col5a3Q9JLI2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col5a3Q9JLI2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Col5a3Q9JLI2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Col5a3Q9JLI2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col5a3Q9JLI2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col5a3Q9JLI2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col5a3Q9JLI2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col5a3Q9JLI2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col5a3Q9JLI2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col5a3Q9JLI2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Col5a3Q9JLI2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Col5a3Q9JLI2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col5a3Q9JLI2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Col5a3Q9JLI2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col5a3Q9JLI2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col5a3Q9JLI2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col5a3Q9JLI2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col5a3Q9JLI2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col5a3Q9JLI2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Col5a3Q9JLI2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col5a3Q9JLI2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col5a3Q9JLI2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col5a3Q9JLI2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
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