Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hmgn5Q9JL35 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Hmgn5Q9JL35 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hmgn5Q9JL35 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hmgn5Q9JL35 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hmgn5Q9JL35 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hmgn5Q9JL35 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hmgn5Q9JL35 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hmgn5Q9JL35 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hmgn5Q9JL35 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hmgn5Q9JL35 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hmgn5Q9JL35 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hmgn5Q9JL35 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hmgn5Q9JL35 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hmgn5Q9JL35 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Hmgn5Q9JL35 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hmgn5Q9JL35 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hmgn5Q9JL35 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hmgn5Q9JL35 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hmgn5Q9JL35 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hmgn5Q9JL35 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hmgn5Q9JL35 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hmgn5Q9JL35 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hmgn5Q9JL35 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hmgn5Q9JL35 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Hmgn5Q9JL35 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hmgn5Q9JL35 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hmgn5Q9JL35 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hmgn5Q9JL35 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hmgn5Q9JL35 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hmgn5Q9JL35 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hmgn5Q9JL35 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Hmgn5Q9JL35 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Hmgn5Q9JL35 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hmgn5Q9JL35 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hmgn5Q9JL35 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hmgn5Q9JL35 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hmgn5Q9JL35 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hmgn5Q9JL35 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hmgn5Q9JL35 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hmgn5Q9JL35 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hmgn5Q9JL35 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Hmgn5Q9JL35 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hmgn5Q9JL35 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hmgn5Q9JL35 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hmgn5Q9JL35 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hmgn5Q9JL35 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hmgn5Q9JL35 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hmgn5Q9JL35 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hmgn5Q9JL35 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hmgn5Q9JL35 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hmgn5Q9JL35 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hmgn5Q9JL35 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hmgn5Q9JL35 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hmgn5Q9JL35 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hmgn5Q9JL35 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hmgn5Q9JL35 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hmgn5Q9JL35 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hmgn5Q9JL35 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hmgn5Q9JL35 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hmgn5Q9JL35 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hmgn5Q9JL35 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hmgn5Q9JL35 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Hmgn5Q9JL35 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hmgn5Q9JL35 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hmgn5Q9JL35 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hmgn5Q9JL35 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hmgn5Q9JL35 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hmgn5Q9JL35 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hmgn5Q9JL35 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hmgn5Q9JL35 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hmgn5Q9JL35 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hmgn5Q9JL35 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hmgn5Q9JL35 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hmgn5Q9JL35 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hmgn5Q9JL35 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hmgn5Q9JL35 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hmgn5Q9JL35 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hmgn5Q9JL35 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hmgn5Q9JL35 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hmgn5Q9JL35 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hmgn5Q9JL35 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hmgn5Q9JL35 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hmgn5Q9JL35 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hmgn5Q9JL35 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hmgn5Q9JL35 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hmgn5Q9JL35 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hmgn5Q9JL35 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hmgn5Q9JL35 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hmgn5Q9JL35 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hmgn5Q9JL35 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hmgn5Q9JL35 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hmgn5Q9JL35 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hmgn5Q9JL35 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hmgn5Q9JL35 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Hmgn5Q9JL35 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hmgn5Q9JL35 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Hmgn5Q9JL35 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hmgn5Q9JL35 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hmgn5Q9JL35 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms