Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccl28Q9JIL2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccl28Q9JIL2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccl28Q9JIL2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccl28Q9JIL2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccl28Q9JIL2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccl28Q9JIL2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccl28Q9JIL2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccl28Q9JIL2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl28Q9JIL2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl28Q9JIL2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl28Q9JIL2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl28Q9JIL2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl28Q9JIL2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl28Q9JIL2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl28Q9JIL2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl28Q9JIL2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl28Q9JIL2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl28Q9JIL2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl28Q9JIL2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl28Q9JIL2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl28Q9JIL2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccl28Q9JIL2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl28Q9JIL2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl28Q9JIL2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl28Q9JIL2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl28Q9JIL2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl28Q9JIL2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl28Q9JIL2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl28Q9JIL2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl28Q9JIL2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl28Q9JIL2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl28Q9JIL2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl28Q9JIL2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccl28Q9JIL2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl28Q9JIL2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl28Q9JIL2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl28Q9JIL2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl28Q9JIL2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl28Q9JIL2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl28Q9JIL2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl28Q9JIL2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl28Q9JIL2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl28Q9JIL2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl28Q9JIL2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl28Q9JIL2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl28Q9JIL2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl28Q9JIL2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl28Q9JIL2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl28Q9JIL2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl28Q9JIL2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl28Q9JIL2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl28Q9JIL2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl28Q9JIL2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl28Q9JIL2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl28Q9JIL2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl28Q9JIL2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl28Q9JIL2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl28Q9JIL2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccl28Q9JIL2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccl28Q9JIL2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccl28Q9JIL2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccl28Q9JIL2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccl28Q9JIL2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccl28Q9JIL2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccl28Q9JIL2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccl28Q9JIL2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl28Q9JIL2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl28Q9JIL2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl28Q9JIL2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl28Q9JIL2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl28Q9JIL2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl28Q9JIL2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl28Q9JIL2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl28Q9JIL2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl28Q9JIL2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl28Q9JIL2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl28Q9JIL2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl28Q9JIL2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl28Q9JIL2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl28Q9JIL2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl28Q9JIL2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl28Q9JIL2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl28Q9JIL2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl28Q9JIL2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl28Q9JIL2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl28Q9JIL2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl28Q9JIL2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl28Q9JIL2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl28Q9JIL2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl28Q9JIL2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl28Q9JIL2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl28Q9JIL2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl28Q9JIL2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl28Q9JIL2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl28Q9JIL2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl28Q9JIL2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl28Q9JIL2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl28Q9JIL2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl28Q9JIL2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.4 ms