Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc22Q9JIG7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc22Q9JIG7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc22Q9JIG7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc22Q9JIG7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc22Q9JIG7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc22Q9JIG7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc22Q9JIG7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc22Q9JIG7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc22Q9JIG7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc22Q9JIG7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc22Q9JIG7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc22Q9JIG7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc22Q9JIG7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc22Q9JIG7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc22Q9JIG7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc22Q9JIG7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc22Q9JIG7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc22Q9JIG7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc22Q9JIG7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc22Q9JIG7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc22Q9JIG7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc22Q9JIG7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc22Q9JIG7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc22Q9JIG7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc22Q9JIG7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc22Q9JIG7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc22Q9JIG7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc22Q9JIG7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc22Q9JIG7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc22Q9JIG7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc22Q9JIG7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc22Q9JIG7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc22Q9JIG7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc22Q9JIG7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc22Q9JIG7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc22Q9JIG7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc22Q9JIG7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc22Q9JIG7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc22Q9JIG7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc22Q9JIG7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc22Q9JIG7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc22Q9JIG7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc22Q9JIG7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc22Q9JIG7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc22Q9JIG7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc22Q9JIG7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc22Q9JIG7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc22Q9JIG7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc22Q9JIG7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc22Q9JIG7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc22Q9JIG7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc22Q9JIG7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc22Q9JIG7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc22Q9JIG7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc22Q9JIG7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc22Q9JIG7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc22Q9JIG7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc22Q9JIG7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc22Q9JIG7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc22Q9JIG7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc22Q9JIG7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc22Q9JIG7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc22Q9JIG7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc22Q9JIG7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc22Q9JIG7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc22Q9JIG7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc22Q9JIG7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc22Q9JIG7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc22Q9JIG7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc22Q9JIG7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc22Q9JIG7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc22Q9JIG7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc22Q9JIG7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc22Q9JIG7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc22Q9JIG7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc22Q9JIG7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc22Q9JIG7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc22Q9JIG7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc22Q9JIG7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc22Q9JIG7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc22Q9JIG7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc22Q9JIG7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc22Q9JIG7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc22Q9JIG7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc22Q9JIG7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc22Q9JIG7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc22Q9JIG7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc22Q9JIG7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc22Q9JIG7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc22Q9JIG7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc22Q9JIG7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc22Q9JIG7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc22Q9JIG7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc22Q9JIG7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc22Q9JIG7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc22Q9JIG7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc22Q9JIG7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc22Q9JIG7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc22Q9JIG7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms