Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
OtofQ9ESF1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
OtofQ9ESF1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
OtofQ9ESF1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OtofQ9ESF1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OtofQ9ESF1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
OtofQ9ESF1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
OtofQ9ESF1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
OtofQ9ESF1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
OtofQ9ESF1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
OtofQ9ESF1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
OtofQ9ESF1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
OtofQ9ESF1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
OtofQ9ESF1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
OtofQ9ESF1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
OtofQ9ESF1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
OtofQ9ESF1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
OtofQ9ESF1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
OtofQ9ESF1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
OtofQ9ESF1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
OtofQ9ESF1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
OtofQ9ESF1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
OtofQ9ESF1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
OtofQ9ESF1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
OtofQ9ESF1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
OtofQ9ESF1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
OtofQ9ESF1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
OtofQ9ESF1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
OtofQ9ESF1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
OtofQ9ESF1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
OtofQ9ESF1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
OtofQ9ESF1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
OtofQ9ESF1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
OtofQ9ESF1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
OtofQ9ESF1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
OtofQ9ESF1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OtofQ9ESF1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OtofQ9ESF1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OtofQ9ESF1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OtofQ9ESF1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OtofQ9ESF1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OtofQ9ESF1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
OtofQ9ESF1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
OtofQ9ESF1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
OtofQ9ESF1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
OtofQ9ESF1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
OtofQ9ESF1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
OtofQ9ESF1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
OtofQ9ESF1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
OtofQ9ESF1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
OtofQ9ESF1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
OtofQ9ESF1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
OtofQ9ESF1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
OtofQ9ESF1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
OtofQ9ESF1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
OtofQ9ESF1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
OtofQ9ESF1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
OtofQ9ESF1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
OtofQ9ESF1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
OtofQ9ESF1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
OtofQ9ESF1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
OtofQ9ESF1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
OtofQ9ESF1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
OtofQ9ESF1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
OtofQ9ESF1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
OtofQ9ESF1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
OtofQ9ESF1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
OtofQ9ESF1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
OtofQ9ESF1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
OtofQ9ESF1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
OtofQ9ESF1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
OtofQ9ESF1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
OtofQ9ESF1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
OtofQ9ESF1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
OtofQ9ESF1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
OtofQ9ESF1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
OtofQ9ESF1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
OtofQ9ESF1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
OtofQ9ESF1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
OtofQ9ESF1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
OtofQ9ESF1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
OtofQ9ESF1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
OtofQ9ESF1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
OtofQ9ESF1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
OtofQ9ESF1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
OtofQ9ESF1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
OtofQ9ESF1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
OtofQ9ESF1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
OtofQ9ESF1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
OtofQ9ESF1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
OtofQ9ESF1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
OtofQ9ESF1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
OtofQ9ESF1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
OtofQ9ESF1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
OtofQ9ESF1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
OtofQ9ESF1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
OtofQ9ESF1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
OtofQ9ESF1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
OtofQ9ESF1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
OtofQ9ESF1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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