Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ47

Vmn1r44, Vomeronasal type-1 receptor 44, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r44Q9EQ47 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r44Q9EQ47 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r44Q9EQ47 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r44Q9EQ47 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r44Q9EQ47 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r44Q9EQ47 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r44Q9EQ47 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r44Q9EQ47 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r44Q9EQ47 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r44Q9EQ47 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r44Q9EQ47 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r44Q9EQ47 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r44Q9EQ47 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r44Q9EQ47 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r44Q9EQ47 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r44Q9EQ47 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r44Q9EQ47 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r44Q9EQ47 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r44Q9EQ47 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r44Q9EQ47 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r44Q9EQ47 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r44Q9EQ47 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r44Q9EQ47 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r44Q9EQ47 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r44Q9EQ47 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r44Q9EQ47 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r44Q9EQ47 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r44Q9EQ47 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn1r44Q9EQ47 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn1r44Q9EQ47 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r44Q9EQ47 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn1r44Q9EQ47 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn1r44Q9EQ47 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn1r44Q9EQ47 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn1r44Q9EQ47 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn1r44Q9EQ47 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn1r44Q9EQ47 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn1r44Q9EQ47 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r44Q9EQ47 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r44Q9EQ47 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms