Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xab2Q9DCD2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xab2Q9DCD2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xab2Q9DCD2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xab2Q9DCD2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xab2Q9DCD2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Xab2Q9DCD2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Xab2Q9DCD2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Xab2Q9DCD2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Xab2Q9DCD2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Xab2Q9DCD2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Xab2Q9DCD2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Xab2Q9DCD2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Xab2Q9DCD2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Xab2Q9DCD2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Xab2Q9DCD2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Xab2Q9DCD2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Xab2Q9DCD2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Xab2Q9DCD2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Xab2Q9DCD2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Xab2Q9DCD2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Xab2Q9DCD2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Xab2Q9DCD2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Xab2Q9DCD2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Xab2Q9DCD2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Xab2Q9DCD2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Xab2Q9DCD2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Xab2Q9DCD2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Xab2Q9DCD2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Xab2Q9DCD2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Xab2Q9DCD2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Xab2Q9DCD2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Xab2Q9DCD2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Xab2Q9DCD2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Xab2Q9DCD2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Xab2Q9DCD2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Xab2Q9DCD2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Xab2Q9DCD2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Xab2Q9DCD2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Xab2Q9DCD2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Xab2Q9DCD2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Xab2Q9DCD2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Xab2Q9DCD2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Xab2Q9DCD2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Xab2Q9DCD2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Xab2Q9DCD2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Xab2Q9DCD2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Xab2Q9DCD2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Xab2Q9DCD2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Xab2Q9DCD2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Xab2Q9DCD2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Xab2Q9DCD2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Xab2Q9DCD2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Xab2Q9DCD2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Xab2Q9DCD2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Xab2Q9DCD2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Xab2Q9DCD2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Xab2Q9DCD2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Xab2Q9DCD2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Xab2Q9DCD2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Xab2Q9DCD2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Xab2Q9DCD2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Xab2Q9DCD2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Xab2Q9DCD2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Xab2Q9DCD2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Xab2Q9DCD2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Xab2Q9DCD2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Xab2Q9DCD2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Xab2Q9DCD2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Xab2Q9DCD2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Xab2Q9DCD2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Xab2Q9DCD2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Xab2Q9DCD2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Xab2Q9DCD2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Xab2Q9DCD2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Xab2Q9DCD2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Xab2Q9DCD2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Xab2Q9DCD2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Xab2Q9DCD2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Xab2Q9DCD2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Xab2Q9DCD2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Xab2Q9DCD2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Xab2Q9DCD2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Xab2Q9DCD2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Xab2Q9DCD2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Xab2Q9DCD2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Xab2Q9DCD2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Xab2Q9DCD2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Xab2Q9DCD2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Xab2Q9DCD2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Xab2Q9DCD2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Xab2Q9DCD2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Xab2Q9DCD2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Xab2Q9DCD2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Xab2Q9DCD2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Xab2Q9DCD2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Xab2Q9DCD2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Xab2Q9DCD2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Xab2Q9DCD2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Xab2Q9DCD2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms