Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf6Q9DBU5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf6Q9DBU5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf6Q9DBU5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf6Q9DBU5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Rnf6Q9DBU5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Rnf6Q9DBU5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf6Q9DBU5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf6Q9DBU5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf6Q9DBU5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf6Q9DBU5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf6Q9DBU5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf6Q9DBU5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf6Q9DBU5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf6Q9DBU5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf6Q9DBU5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf6Q9DBU5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf6Q9DBU5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf6Q9DBU5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf6Q9DBU5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf6Q9DBU5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf6Q9DBU5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf6Q9DBU5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf6Q9DBU5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf6Q9DBU5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf6Q9DBU5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf6Q9DBU5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf6Q9DBU5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf6Q9DBU5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf6Q9DBU5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf6Q9DBU5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf6Q9DBU5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf6Q9DBU5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf6Q9DBU5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf6Q9DBU5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf6Q9DBU5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf6Q9DBU5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf6Q9DBU5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf6Q9DBU5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf6Q9DBU5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf6Q9DBU5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf6Q9DBU5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf6Q9DBU5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf6Q9DBU5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf6Q9DBU5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf6Q9DBU5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf6Q9DBU5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf6Q9DBU5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf6Q9DBU5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf6Q9DBU5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf6Q9DBU5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf6Q9DBU5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf6Q9DBU5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf6Q9DBU5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf6Q9DBU5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf6Q9DBU5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf6Q9DBU5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf6Q9DBU5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf6Q9DBU5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf6Q9DBU5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf6Q9DBU5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf6Q9DBU5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf6Q9DBU5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf6Q9DBU5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf6Q9DBU5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf6Q9DBU5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf6Q9DBU5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf6Q9DBU5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf6Q9DBU5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf6Q9DBU5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf6Q9DBU5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf6Q9DBU5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf6Q9DBU5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf6Q9DBU5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf6Q9DBU5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf6Q9DBU5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf6Q9DBU5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf6Q9DBU5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf6Q9DBU5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf6Q9DBU5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf6Q9DBU5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf6Q9DBU5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf6Q9DBU5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf6Q9DBU5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf6Q9DBU5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf6Q9DBU5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf6Q9DBU5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf6Q9DBU5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf6Q9DBU5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf6Q9DBU5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf6Q9DBU5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf6Q9DBU5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf6Q9DBU5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf6Q9DBU5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf6Q9DBU5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf6Q9DBU5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf6Q9DBU5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf6Q9DBU5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf6Q9DBU5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rnf6Q9DBU5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.6 ms