Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Swt1Q9DBQ9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Swt1Q9DBQ9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Swt1Q9DBQ9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Swt1Q9DBQ9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Swt1Q9DBQ9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Swt1Q9DBQ9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Swt1Q9DBQ9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Swt1Q9DBQ9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Swt1Q9DBQ9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Swt1Q9DBQ9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Swt1Q9DBQ9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Swt1Q9DBQ9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Swt1Q9DBQ9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Swt1Q9DBQ9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Swt1Q9DBQ9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Swt1Q9DBQ9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Swt1Q9DBQ9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Swt1Q9DBQ9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Swt1Q9DBQ9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Swt1Q9DBQ9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Swt1Q9DBQ9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Swt1Q9DBQ9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Swt1Q9DBQ9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Swt1Q9DBQ9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Swt1Q9DBQ9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Swt1Q9DBQ9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Swt1Q9DBQ9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Swt1Q9DBQ9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Swt1Q9DBQ9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Swt1Q9DBQ9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Swt1Q9DBQ9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Swt1Q9DBQ9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Swt1Q9DBQ9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Swt1Q9DBQ9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Swt1Q9DBQ9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Swt1Q9DBQ9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Swt1Q9DBQ9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Swt1Q9DBQ9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Swt1Q9DBQ9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Swt1Q9DBQ9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Swt1Q9DBQ9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Swt1Q9DBQ9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Swt1Q9DBQ9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Swt1Q9DBQ9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Swt1Q9DBQ9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Swt1Q9DBQ9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Swt1Q9DBQ9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Swt1Q9DBQ9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Swt1Q9DBQ9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Swt1Q9DBQ9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Swt1Q9DBQ9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Swt1Q9DBQ9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Swt1Q9DBQ9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Swt1Q9DBQ9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Swt1Q9DBQ9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Swt1Q9DBQ9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Swt1Q9DBQ9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Swt1Q9DBQ9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Swt1Q9DBQ9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Swt1Q9DBQ9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Swt1Q9DBQ9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Swt1Q9DBQ9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Swt1Q9DBQ9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Swt1Q9DBQ9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Swt1Q9DBQ9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Swt1Q9DBQ9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Swt1Q9DBQ9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Swt1Q9DBQ9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Swt1Q9DBQ9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Swt1Q9DBQ9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Swt1Q9DBQ9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Swt1Q9DBQ9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Swt1Q9DBQ9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Swt1Q9DBQ9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Swt1Q9DBQ9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Swt1Q9DBQ9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Swt1Q9DBQ9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Swt1Q9DBQ9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Swt1Q9DBQ9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Swt1Q9DBQ9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Swt1Q9DBQ9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Swt1Q9DBQ9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Swt1Q9DBQ9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Swt1Q9DBQ9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Swt1Q9DBQ9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Swt1Q9DBQ9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Swt1Q9DBQ9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Swt1Q9DBQ9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Swt1Q9DBQ9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Swt1Q9DBQ9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Swt1Q9DBQ9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Swt1Q9DBQ9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Swt1Q9DBQ9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Swt1Q9DBQ9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Swt1Q9DBQ9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Swt1Q9DBQ9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Swt1Q9DBQ9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Swt1Q9DBQ9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Swt1Q9DBQ9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms