Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA83

1700018B08Rik, RIKEN cDNA 1700018B08, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018B08RikQ9DA83 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
1700018B08RikQ9DA83 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
1700018B08RikQ9DA83 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
1700018B08RikQ9DA83 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
1700018B08RikQ9DA83 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
1700018B08RikQ9DA83 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
1700018B08RikQ9DA83 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
1700018B08RikQ9DA83 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
1700018B08RikQ9DA83 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
1700018B08RikQ9DA83 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
1700018B08RikQ9DA83 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
1700018B08RikQ9DA83 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
1700018B08RikQ9DA83 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
1700018B08RikQ9DA83 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
1700018B08RikQ9DA83 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
1700018B08RikQ9DA83 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
1700018B08RikQ9DA83 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
1700018B08RikQ9DA83 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
1700018B08RikQ9DA83 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
1700018B08RikQ9DA83 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
1700018B08RikQ9DA83 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
1700018B08RikQ9DA83 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
1700018B08RikQ9DA83 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
1700018B08RikQ9DA83 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
1700018B08RikQ9DA83 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
1700018B08RikQ9DA83 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
1700018B08RikQ9DA83 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
1700018B08RikQ9DA83 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
1700018B08RikQ9DA83 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
1700018B08RikQ9DA83 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
1700018B08RikQ9DA83 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
1700018B08RikQ9DA83 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
1700018B08RikQ9DA83 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
1700018B08RikQ9DA83 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
1700018B08RikQ9DA83 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
1700018B08RikQ9DA83 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
1700018B08RikQ9DA83 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
1700018B08RikQ9DA83 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
1700018B08RikQ9DA83 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
1700018B08RikQ9DA83 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
1700018B08RikQ9DA83 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
1700018B08RikQ9DA83 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
1700018B08RikQ9DA83 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
1700018B08RikQ9DA83 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
1700018B08RikQ9DA83 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
1700018B08RikQ9DA83 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
1700018B08RikQ9DA83 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
1700018B08RikQ9DA83 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
1700018B08RikQ9DA83 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
1700018B08RikQ9DA83 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
1700018B08RikQ9DA83 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
1700018B08RikQ9DA83 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
1700018B08RikQ9DA83 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
1700018B08RikQ9DA83 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
1700018B08RikQ9DA83 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
1700018B08RikQ9DA83 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
1700018B08RikQ9DA83 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
1700018B08RikQ9DA83 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
1700018B08RikQ9DA83 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
1700018B08RikQ9DA83 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
1700018B08RikQ9DA83 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
1700018B08RikQ9DA83 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
1700018B08RikQ9DA83 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
1700018B08RikQ9DA83 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
1700018B08RikQ9DA83 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
1700018B08RikQ9DA83 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
1700018B08RikQ9DA83 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
1700018B08RikQ9DA83 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
1700018B08RikQ9DA83 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
1700018B08RikQ9DA83 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
1700018B08RikQ9DA83 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
1700018B08RikQ9DA83 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
1700018B08RikQ9DA83 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
1700018B08RikQ9DA83 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
1700018B08RikQ9DA83 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
1700018B08RikQ9DA83 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
1700018B08RikQ9DA83 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
1700018B08RikQ9DA83 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
1700018B08RikQ9DA83 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
1700018B08RikQ9DA83 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
1700018B08RikQ9DA83 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
1700018B08RikQ9DA83 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
1700018B08RikQ9DA83 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
1700018B08RikQ9DA83 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
1700018B08RikQ9DA83 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
1700018B08RikQ9DA83 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
1700018B08RikQ9DA83 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
1700018B08RikQ9DA83 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
1700018B08RikQ9DA83 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
1700018B08RikQ9DA83 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
1700018B08RikQ9DA83 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
1700018B08RikQ9DA83 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
1700018B08RikQ9DA83 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
1700018B08RikQ9DA83 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
1700018B08RikQ9DA83 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
1700018B08RikQ9DA83 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
1700018B08RikQ9DA83 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
1700018B08RikQ9DA83 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
1700018B08RikQ9DA83 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
1700018B08RikQ9DA83 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms