Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9P2

Ccdc103, Coiled-coil domain-containing protein 103, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc103Q9D9P2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc103Q9D9P2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc103Q9D9P2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc103Q9D9P2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc103Q9D9P2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc103Q9D9P2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc103Q9D9P2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc103Q9D9P2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc103Q9D9P2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc103Q9D9P2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc103Q9D9P2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc103Q9D9P2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc103Q9D9P2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc103Q9D9P2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc103Q9D9P2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc103Q9D9P2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc103Q9D9P2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc103Q9D9P2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc103Q9D9P2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc103Q9D9P2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc103Q9D9P2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc103Q9D9P2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc103Q9D9P2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc103Q9D9P2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc103Q9D9P2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc103Q9D9P2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc103Q9D9P2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc103Q9D9P2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc103Q9D9P2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc103Q9D9P2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc103Q9D9P2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc103Q9D9P2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc103Q9D9P2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc103Q9D9P2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc103Q9D9P2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc103Q9D9P2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc103Q9D9P2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc103Q9D9P2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc103Q9D9P2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc103Q9D9P2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc103Q9D9P2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc103Q9D9P2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc103Q9D9P2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc103Q9D9P2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc103Q9D9P2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc103Q9D9P2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc103Q9D9P2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc103Q9D9P2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc103Q9D9P2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc103Q9D9P2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc103Q9D9P2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc103Q9D9P2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc103Q9D9P2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc103Q9D9P2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc103Q9D9P2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc103Q9D9P2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc103Q9D9P2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc103Q9D9P2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc103Q9D9P2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc103Q9D9P2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc103Q9D9P2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc103Q9D9P2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc103Q9D9P2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc103Q9D9P2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc103Q9D9P2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc103Q9D9P2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc103Q9D9P2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc103Q9D9P2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc103Q9D9P2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc103Q9D9P2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc103Q9D9P2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc103Q9D9P2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc103Q9D9P2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc103Q9D9P2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc103Q9D9P2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc103Q9D9P2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc103Q9D9P2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc103Q9D9P2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc103Q9D9P2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc103Q9D9P2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc103Q9D9P2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc103Q9D9P2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc103Q9D9P2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc103Q9D9P2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc103Q9D9P2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc103Q9D9P2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc103Q9D9P2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc103Q9D9P2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc103Q9D9P2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc103Q9D9P2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc103Q9D9P2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc103Q9D9P2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc103Q9D9P2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc103Q9D9P2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc103Q9D9P2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc103Q9D9P2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc103Q9D9P2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc103Q9D9P2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc103Q9D9P2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc103Q9D9P2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms