Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Alkbh4Q9D8F1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Alkbh4Q9D8F1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Alkbh4Q9D8F1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Alkbh4Q9D8F1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Alkbh4Q9D8F1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Alkbh4Q9D8F1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Alkbh4Q9D8F1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Alkbh4Q9D8F1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Alkbh4Q9D8F1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Alkbh4Q9D8F1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Alkbh4Q9D8F1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Alkbh4Q9D8F1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Alkbh4Q9D8F1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Alkbh4Q9D8F1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Alkbh4Q9D8F1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Alkbh4Q9D8F1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Alkbh4Q9D8F1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Alkbh4Q9D8F1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Alkbh4Q9D8F1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Alkbh4Q9D8F1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Alkbh4Q9D8F1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Alkbh4Q9D8F1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Alkbh4Q9D8F1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Alkbh4Q9D8F1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Alkbh4Q9D8F1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Alkbh4Q9D8F1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Alkbh4Q9D8F1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Alkbh4Q9D8F1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Alkbh4Q9D8F1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Alkbh4Q9D8F1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Alkbh4Q9D8F1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Alkbh4Q9D8F1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Alkbh4Q9D8F1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Alkbh4Q9D8F1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Alkbh4Q9D8F1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Alkbh4Q9D8F1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Alkbh4Q9D8F1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Alkbh4Q9D8F1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Alkbh4Q9D8F1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Alkbh4Q9D8F1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Alkbh4Q9D8F1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Alkbh4Q9D8F1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Alkbh4Q9D8F1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Alkbh4Q9D8F1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Alkbh4Q9D8F1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Alkbh4Q9D8F1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Alkbh4Q9D8F1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Alkbh4Q9D8F1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Alkbh4Q9D8F1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Alkbh4Q9D8F1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Alkbh4Q9D8F1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Alkbh4Q9D8F1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Alkbh4Q9D8F1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Alkbh4Q9D8F1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Alkbh4Q9D8F1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Alkbh4Q9D8F1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Alkbh4Q9D8F1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Alkbh4Q9D8F1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Alkbh4Q9D8F1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Alkbh4Q9D8F1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Alkbh4Q9D8F1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Alkbh4Q9D8F1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Alkbh4Q9D8F1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Alkbh4Q9D8F1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Alkbh4Q9D8F1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Alkbh4Q9D8F1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Alkbh4Q9D8F1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Alkbh4Q9D8F1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Alkbh4Q9D8F1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Alkbh4Q9D8F1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Alkbh4Q9D8F1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Alkbh4Q9D8F1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Alkbh4Q9D8F1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Alkbh4Q9D8F1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Alkbh4Q9D8F1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Alkbh4Q9D8F1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Alkbh4Q9D8F1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Alkbh4Q9D8F1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Alkbh4Q9D8F1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Alkbh4Q9D8F1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Alkbh4Q9D8F1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Alkbh4Q9D8F1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Alkbh4Q9D8F1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Alkbh4Q9D8F1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Alkbh4Q9D8F1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Alkbh4Q9D8F1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Alkbh4Q9D8F1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Alkbh4Q9D8F1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Alkbh4Q9D8F1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Alkbh4Q9D8F1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Alkbh4Q9D8F1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Alkbh4Q9D8F1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Alkbh4Q9D8F1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Alkbh4Q9D8F1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Alkbh4Q9D8F1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Alkbh4Q9D8F1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Alkbh4Q9D8F1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Alkbh4Q9D8F1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Alkbh4Q9D8F1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms