Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rpl4Q9D8E6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rpl4Q9D8E6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Rpl4Q9D8E6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rpl4Q9D8E6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rpl4Q9D8E6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rpl4Q9D8E6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rpl4Q9D8E6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpl4Q9D8E6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpl4Q9D8E6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpl4Q9D8E6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpl4Q9D8E6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Rpl4Q9D8E6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Rpl4Q9D8E6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Rpl4Q9D8E6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Rpl4Q9D8E6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rpl4Q9D8E6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpl4Q9D8E6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rpl4Q9D8E6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rpl4Q9D8E6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rpl4Q9D8E6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rpl4Q9D8E6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rpl4Q9D8E6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rpl4Q9D8E6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rpl4Q9D8E6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rpl4Q9D8E6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Rpl4Q9D8E6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rpl4Q9D8E6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rpl4Q9D8E6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rpl4Q9D8E6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpl4Q9D8E6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpl4Q9D8E6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpl4Q9D8E6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpl4Q9D8E6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpl4Q9D8E6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpl4Q9D8E6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpl4Q9D8E6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpl4Q9D8E6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpl4Q9D8E6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpl4Q9D8E6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpl4Q9D8E6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpl4Q9D8E6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpl4Q9D8E6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpl4Q9D8E6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpl4Q9D8E6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpl4Q9D8E6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpl4Q9D8E6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl4Q9D8E6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl4Q9D8E6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl4Q9D8E6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl4Q9D8E6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl4Q9D8E6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl4Q9D8E6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl4Q9D8E6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl4Q9D8E6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl4Q9D8E6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl4Q9D8E6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl4Q9D8E6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl4Q9D8E6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl4Q9D8E6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl4Q9D8E6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl4Q9D8E6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl4Q9D8E6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl4Q9D8E6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl4Q9D8E6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl4Q9D8E6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl4Q9D8E6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl4Q9D8E6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl4Q9D8E6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl4Q9D8E6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpl4Q9D8E6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpl4Q9D8E6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpl4Q9D8E6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpl4Q9D8E6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpl4Q9D8E6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpl4Q9D8E6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpl4Q9D8E6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpl4Q9D8E6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpl4Q9D8E6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpl4Q9D8E6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpl4Q9D8E6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpl4Q9D8E6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpl4Q9D8E6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpl4Q9D8E6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpl4Q9D8E6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpl4Q9D8E6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpl4Q9D8E6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpl4Q9D8E6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpl4Q9D8E6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpl4Q9D8E6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpl4Q9D8E6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpl4Q9D8E6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpl4Q9D8E6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpl4Q9D8E6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpl4Q9D8E6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpl4Q9D8E6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpl4Q9D8E6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpl4Q9D8E6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpl4Q9D8E6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpl4Q9D8E6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms