Protein–RNA interactions for Protein: Q9D842

Aplf, Aprataxin and PNK-like factor, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AplfQ9D842 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
AplfQ9D842 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
AplfQ9D842 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
AplfQ9D842 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
AplfQ9D842 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
AplfQ9D842 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
AplfQ9D842 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
AplfQ9D842 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AplfQ9D842 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AplfQ9D842 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AplfQ9D842 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AplfQ9D842 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AplfQ9D842 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
AplfQ9D842 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AplfQ9D842 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
AplfQ9D842 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
AplfQ9D842 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AplfQ9D842 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AplfQ9D842 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AplfQ9D842 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
AplfQ9D842 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
AplfQ9D842 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
AplfQ9D842 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AplfQ9D842 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AplfQ9D842 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AplfQ9D842 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AplfQ9D842 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AplfQ9D842 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AplfQ9D842 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AplfQ9D842 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AplfQ9D842 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AplfQ9D842 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AplfQ9D842 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AplfQ9D842 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AplfQ9D842 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AplfQ9D842 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AplfQ9D842 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AplfQ9D842 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AplfQ9D842 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AplfQ9D842 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AplfQ9D842 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AplfQ9D842 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AplfQ9D842 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AplfQ9D842 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AplfQ9D842 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AplfQ9D842 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AplfQ9D842 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AplfQ9D842 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AplfQ9D842 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
AplfQ9D842 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AplfQ9D842 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AplfQ9D842 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AplfQ9D842 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
AplfQ9D842 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AplfQ9D842 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AplfQ9D842 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AplfQ9D842 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AplfQ9D842 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AplfQ9D842 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AplfQ9D842 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AplfQ9D842 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AplfQ9D842 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AplfQ9D842 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AplfQ9D842 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AplfQ9D842 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AplfQ9D842 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AplfQ9D842 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AplfQ9D842 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AplfQ9D842 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AplfQ9D842 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AplfQ9D842 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
AplfQ9D842 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AplfQ9D842 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AplfQ9D842 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AplfQ9D842 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AplfQ9D842 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AplfQ9D842 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AplfQ9D842 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
AplfQ9D842 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
AplfQ9D842 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AplfQ9D842 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AplfQ9D842 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AplfQ9D842 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AplfQ9D842 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AplfQ9D842 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AplfQ9D842 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AplfQ9D842 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AplfQ9D842 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AplfQ9D842 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AplfQ9D842 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AplfQ9D842 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms