Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D1

Rnf225, RING finger protein 225, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf225Q9D7D1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf225Q9D7D1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf225Q9D7D1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf225Q9D7D1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf225Q9D7D1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf225Q9D7D1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf225Q9D7D1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf225Q9D7D1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf225Q9D7D1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf225Q9D7D1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf225Q9D7D1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf225Q9D7D1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf225Q9D7D1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf225Q9D7D1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf225Q9D7D1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf225Q9D7D1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf225Q9D7D1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rnf225Q9D7D1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf225Q9D7D1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf225Q9D7D1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf225Q9D7D1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf225Q9D7D1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf225Q9D7D1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf225Q9D7D1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf225Q9D7D1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf225Q9D7D1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf225Q9D7D1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf225Q9D7D1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf225Q9D7D1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf225Q9D7D1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf225Q9D7D1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf225Q9D7D1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf225Q9D7D1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf225Q9D7D1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf225Q9D7D1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf225Q9D7D1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf225Q9D7D1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf225Q9D7D1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf225Q9D7D1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf225Q9D7D1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf225Q9D7D1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf225Q9D7D1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf225Q9D7D1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf225Q9D7D1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf225Q9D7D1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf225Q9D7D1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf225Q9D7D1 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf225Q9D7D1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf225Q9D7D1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf225Q9D7D1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf225Q9D7D1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf225Q9D7D1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf225Q9D7D1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf225Q9D7D1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf225Q9D7D1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf225Q9D7D1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf225Q9D7D1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf225Q9D7D1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf225Q9D7D1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf225Q9D7D1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf225Q9D7D1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf225Q9D7D1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf225Q9D7D1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf225Q9D7D1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf225Q9D7D1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf225Q9D7D1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf225Q9D7D1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf225Q9D7D1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf225Q9D7D1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf225Q9D7D1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf225Q9D7D1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf225Q9D7D1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf225Q9D7D1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf225Q9D7D1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf225Q9D7D1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf225Q9D7D1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf225Q9D7D1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf225Q9D7D1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf225Q9D7D1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf225Q9D7D1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf225Q9D7D1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf225Q9D7D1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf225Q9D7D1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf225Q9D7D1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf225Q9D7D1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf225Q9D7D1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf225Q9D7D1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf225Q9D7D1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf225Q9D7D1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf225Q9D7D1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf225Q9D7D1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf225Q9D7D1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf225Q9D7D1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf225Q9D7D1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf225Q9D7D1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf225Q9D7D1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf225Q9D7D1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf225Q9D7D1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf225Q9D7D1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf225Q9D7D1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms