Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klhl40Q9D783 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klhl40Q9D783 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klhl40Q9D783 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Klhl40Q9D783 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Klhl40Q9D783 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Klhl40Q9D783 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Klhl40Q9D783 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Klhl40Q9D783 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Klhl40Q9D783 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Klhl40Q9D783 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Klhl40Q9D783 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhl40Q9D783 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhl40Q9D783 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhl40Q9D783 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhl40Q9D783 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhl40Q9D783 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhl40Q9D783 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhl40Q9D783 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klhl40Q9D783 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klhl40Q9D783 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klhl40Q9D783 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klhl40Q9D783 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klhl40Q9D783 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klhl40Q9D783 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klhl40Q9D783 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Klhl40Q9D783 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klhl40Q9D783 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klhl40Q9D783 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Klhl40Q9D783 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Klhl40Q9D783 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klhl40Q9D783 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klhl40Q9D783 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klhl40Q9D783 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klhl40Q9D783 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klhl40Q9D783 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klhl40Q9D783 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klhl40Q9D783 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klhl40Q9D783 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klhl40Q9D783 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klhl40Q9D783 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klhl40Q9D783 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klhl40Q9D783 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klhl40Q9D783 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klhl40Q9D783 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klhl40Q9D783 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klhl40Q9D783 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klhl40Q9D783 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klhl40Q9D783 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klhl40Q9D783 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klhl40Q9D783 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Klhl40Q9D783 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klhl40Q9D783 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Klhl40Q9D783 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klhl40Q9D783 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klhl40Q9D783 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klhl40Q9D783 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klhl40Q9D783 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klhl40Q9D783 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klhl40Q9D783 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klhl40Q9D783 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klhl40Q9D783 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klhl40Q9D783 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klhl40Q9D783 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klhl40Q9D783 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klhl40Q9D783 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klhl40Q9D783 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klhl40Q9D783 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klhl40Q9D783 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klhl40Q9D783 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klhl40Q9D783 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klhl40Q9D783 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klhl40Q9D783 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klhl40Q9D783 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klhl40Q9D783 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klhl40Q9D783 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klhl40Q9D783 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klhl40Q9D783 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klhl40Q9D783 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klhl40Q9D783 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klhl40Q9D783 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klhl40Q9D783 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klhl40Q9D783 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klhl40Q9D783 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klhl40Q9D783 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klhl40Q9D783 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klhl40Q9D783 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Klhl40Q9D783 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klhl40Q9D783 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klhl40Q9D783 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klhl40Q9D783 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klhl40Q9D783 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Klhl40Q9D783 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Klhl40Q9D783 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Klhl40Q9D783 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Klhl40Q9D783 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Klhl40Q9D783 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Klhl40Q9D783 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Klhl40Q9D783 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Klhl40Q9D783 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101 ms