Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zcchc13Q9D548 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zcchc13Q9D548 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zcchc13Q9D548 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zcchc13Q9D548 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zcchc13Q9D548 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zcchc13Q9D548 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zcchc13Q9D548 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zcchc13Q9D548 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zcchc13Q9D548 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zcchc13Q9D548 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Zcchc13Q9D548 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Zcchc13Q9D548 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zcchc13Q9D548 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
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