Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J9

4931423N10Rik, MCG52616, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931423N10RikQ9D4J9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4931423N10RikQ9D4J9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4931423N10RikQ9D4J9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4931423N10RikQ9D4J9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4931423N10RikQ9D4J9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4931423N10RikQ9D4J9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4931423N10RikQ9D4J9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
4931423N10RikQ9D4J9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
4931423N10RikQ9D4J9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
4931423N10RikQ9D4J9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
4931423N10RikQ9D4J9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
4931423N10RikQ9D4J9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
4931423N10RikQ9D4J9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4931423N10RikQ9D4J9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4931423N10RikQ9D4J9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
4931423N10RikQ9D4J9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4931423N10RikQ9D4J9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
4931423N10RikQ9D4J9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
4931423N10RikQ9D4J9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4931423N10RikQ9D4J9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
4931423N10RikQ9D4J9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4931423N10RikQ9D4J9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4931423N10RikQ9D4J9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4931423N10RikQ9D4J9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
4931423N10RikQ9D4J9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4931423N10RikQ9D4J9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
4931423N10RikQ9D4J9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
4931423N10RikQ9D4J9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4931423N10RikQ9D4J9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
4931423N10RikQ9D4J9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4931423N10RikQ9D4J9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4931423N10RikQ9D4J9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4931423N10RikQ9D4J9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4931423N10RikQ9D4J9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4931423N10RikQ9D4J9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
4931423N10RikQ9D4J9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4931423N10RikQ9D4J9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4931423N10RikQ9D4J9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
4931423N10RikQ9D4J9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4931423N10RikQ9D4J9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4931423N10RikQ9D4J9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4931423N10RikQ9D4J9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4931423N10RikQ9D4J9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4931423N10RikQ9D4J9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4931423N10RikQ9D4J9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4931423N10RikQ9D4J9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4931423N10RikQ9D4J9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4931423N10RikQ9D4J9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4931423N10RikQ9D4J9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4931423N10RikQ9D4J9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
4931423N10RikQ9D4J9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4931423N10RikQ9D4J9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4931423N10RikQ9D4J9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4931423N10RikQ9D4J9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4931423N10RikQ9D4J9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4931423N10RikQ9D4J9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4931423N10RikQ9D4J9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
4931423N10RikQ9D4J9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4931423N10RikQ9D4J9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4931423N10RikQ9D4J9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4931423N10RikQ9D4J9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4931423N10RikQ9D4J9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4931423N10RikQ9D4J9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4931423N10RikQ9D4J9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4931423N10RikQ9D4J9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
4931423N10RikQ9D4J9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
4931423N10RikQ9D4J9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4931423N10RikQ9D4J9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
4931423N10RikQ9D4J9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4931423N10RikQ9D4J9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4931423N10RikQ9D4J9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4931423N10RikQ9D4J9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4931423N10RikQ9D4J9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4931423N10RikQ9D4J9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
4931423N10RikQ9D4J9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4931423N10RikQ9D4J9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4931423N10RikQ9D4J9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4931423N10RikQ9D4J9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4931423N10RikQ9D4J9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4931423N10RikQ9D4J9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
4931423N10RikQ9D4J9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4931423N10RikQ9D4J9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
4931423N10RikQ9D4J9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
4931423N10RikQ9D4J9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
4931423N10RikQ9D4J9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4931423N10RikQ9D4J9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4931423N10RikQ9D4J9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4931423N10RikQ9D4J9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4931423N10RikQ9D4J9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4931423N10RikQ9D4J9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4931423N10RikQ9D4J9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
4931423N10RikQ9D4J9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4931423N10RikQ9D4J9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
4931423N10RikQ9D4J9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4931423N10RikQ9D4J9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4931423N10RikQ9D4J9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
4931423N10RikQ9D4J9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4931423N10RikQ9D4J9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4931423N10RikQ9D4J9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4931423N10RikQ9D4J9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms