Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3V5

Fsip1, Fibrous sheath-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fsip1Q9D3V5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fsip1Q9D3V5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fsip1Q9D3V5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fsip1Q9D3V5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fsip1Q9D3V5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fsip1Q9D3V5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fsip1Q9D3V5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Fsip1Q9D3V5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fsip1Q9D3V5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fsip1Q9D3V5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fsip1Q9D3V5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fsip1Q9D3V5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fsip1Q9D3V5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fsip1Q9D3V5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fsip1Q9D3V5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fsip1Q9D3V5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fsip1Q9D3V5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Fsip1Q9D3V5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fsip1Q9D3V5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fsip1Q9D3V5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fsip1Q9D3V5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fsip1Q9D3V5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fsip1Q9D3V5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fsip1Q9D3V5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fsip1Q9D3V5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fsip1Q9D3V5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fsip1Q9D3V5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fsip1Q9D3V5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fsip1Q9D3V5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Fsip1Q9D3V5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Fsip1Q9D3V5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fsip1Q9D3V5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fsip1Q9D3V5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fsip1Q9D3V5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fsip1Q9D3V5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fsip1Q9D3V5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fsip1Q9D3V5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fsip1Q9D3V5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fsip1Q9D3V5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fsip1Q9D3V5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fsip1Q9D3V5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fsip1Q9D3V5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fsip1Q9D3V5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fsip1Q9D3V5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Fsip1Q9D3V5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fsip1Q9D3V5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fsip1Q9D3V5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fsip1Q9D3V5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Fsip1Q9D3V5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fsip1Q9D3V5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fsip1Q9D3V5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fsip1Q9D3V5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fsip1Q9D3V5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fsip1Q9D3V5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fsip1Q9D3V5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fsip1Q9D3V5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fsip1Q9D3V5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fsip1Q9D3V5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fsip1Q9D3V5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fsip1Q9D3V5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fsip1Q9D3V5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fsip1Q9D3V5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Fsip1Q9D3V5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fsip1Q9D3V5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fsip1Q9D3V5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fsip1Q9D3V5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fsip1Q9D3V5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fsip1Q9D3V5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fsip1Q9D3V5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fsip1Q9D3V5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fsip1Q9D3V5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fsip1Q9D3V5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fsip1Q9D3V5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fsip1Q9D3V5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fsip1Q9D3V5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fsip1Q9D3V5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fsip1Q9D3V5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fsip1Q9D3V5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fsip1Q9D3V5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fsip1Q9D3V5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fsip1Q9D3V5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fsip1Q9D3V5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fsip1Q9D3V5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fsip1Q9D3V5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fsip1Q9D3V5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fsip1Q9D3V5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fsip1Q9D3V5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fsip1Q9D3V5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fsip1Q9D3V5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fsip1Q9D3V5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fsip1Q9D3V5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fsip1Q9D3V5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fsip1Q9D3V5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fsip1Q9D3V5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fsip1Q9D3V5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Fsip1Q9D3V5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fsip1Q9D3V5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fsip1Q9D3V5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fsip1Q9D3V5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fsip1Q9D3V5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms