Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx29Q9D3S3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx29Q9D3S3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx29Q9D3S3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx29Q9D3S3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx29Q9D3S3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx29Q9D3S3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx29Q9D3S3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx29Q9D3S3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx29Q9D3S3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx29Q9D3S3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx29Q9D3S3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx29Q9D3S3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx29Q9D3S3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx29Q9D3S3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx29Q9D3S3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx29Q9D3S3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx29Q9D3S3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx29Q9D3S3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx29Q9D3S3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx29Q9D3S3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx29Q9D3S3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx29Q9D3S3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx29Q9D3S3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx29Q9D3S3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx29Q9D3S3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx29Q9D3S3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx29Q9D3S3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx29Q9D3S3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx29Q9D3S3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx29Q9D3S3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx29Q9D3S3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx29Q9D3S3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx29Q9D3S3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx29Q9D3S3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx29Q9D3S3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx29Q9D3S3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx29Q9D3S3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx29Q9D3S3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx29Q9D3S3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx29Q9D3S3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snx29Q9D3S3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snx29Q9D3S3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snx29Q9D3S3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snx29Q9D3S3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snx29Q9D3S3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snx29Q9D3S3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx29Q9D3S3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx29Q9D3S3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx29Q9D3S3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx29Q9D3S3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx29Q9D3S3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx29Q9D3S3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx29Q9D3S3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx29Q9D3S3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx29Q9D3S3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx29Q9D3S3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx29Q9D3S3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx29Q9D3S3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx29Q9D3S3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx29Q9D3S3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx29Q9D3S3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx29Q9D3S3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx29Q9D3S3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx29Q9D3S3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx29Q9D3S3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx29Q9D3S3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx29Q9D3S3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx29Q9D3S3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snx29Q9D3S3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snx29Q9D3S3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snx29Q9D3S3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snx29Q9D3S3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Snx29Q9D3S3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snx29Q9D3S3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snx29Q9D3S3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Snx29Q9D3S3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snx29Q9D3S3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snx29Q9D3S3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snx29Q9D3S3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx29Q9D3S3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx29Q9D3S3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx29Q9D3S3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx29Q9D3S3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx29Q9D3S3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx29Q9D3S3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx29Q9D3S3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx29Q9D3S3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx29Q9D3S3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx29Q9D3S3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx29Q9D3S3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx29Q9D3S3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx29Q9D3S3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx29Q9D3S3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx29Q9D3S3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx29Q9D3S3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx29Q9D3S3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx29Q9D3S3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx29Q9D3S3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx29Q9D3S3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms