Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1K7

UPF0687 protein C20orf27 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1K7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9D1K7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9D1K7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9D1K7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9D1K7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9D1K7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9D1K7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9D1K7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9D1K7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9D1K7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9D1K7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9D1K7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9D1K7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9D1K7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9D1K7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9D1K7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9D1K7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9D1K7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9D1K7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9D1K7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9D1K7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9D1K7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q9D1K7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q9D1K7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q9D1K7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q9D1K7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q9D1K7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q9D1K7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q9D1K7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q9D1K7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q9D1K7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q9D1K7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q9D1K7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q9D1K7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q9D1K7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q9D1K7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q9D1K7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Q9D1K7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q9D1K7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q9D1K7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q9D1K7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q9D1K7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q9D1K7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q9D1K7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Q9D1K7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q9D1K7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q9D1K7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q9D1K7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q9D1K7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q9D1K7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q9D1K7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q9D1K7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q9D1K7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q9D1K7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Q9D1K7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Q9D1K7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Q9D1K7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Q9D1K7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Q9D1K7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Q9D1K7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Q9D1K7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Q9D1K7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q9D1K7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q9D1K7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q9D1K7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q9D1K7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q9D1K7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q9D1K7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q9D1K7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q9D1K7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q9D1K7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q9D1K7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Q9D1K7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q9D1K7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q9D1K7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q9D1K7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q9D1K7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q9D1K7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q9D1K7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q9D1K7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q9D1K7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q9D1K7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q9D1K7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q9D1K7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q9D1K7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q9D1K7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q9D1K7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q9D1K7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q9D1K7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q9D1K7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q9D1K7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q9D1K7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q9D1K7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q9D1K7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q9D1K7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q9D1K7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q9D1K7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q9D1K7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q9D1K7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q9D1K7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms