Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SarnpQ9D1J3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SarnpQ9D1J3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SarnpQ9D1J3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SarnpQ9D1J3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SarnpQ9D1J3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SarnpQ9D1J3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SarnpQ9D1J3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SarnpQ9D1J3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SarnpQ9D1J3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SarnpQ9D1J3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SarnpQ9D1J3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SarnpQ9D1J3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SarnpQ9D1J3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SarnpQ9D1J3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SarnpQ9D1J3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SarnpQ9D1J3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SarnpQ9D1J3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SarnpQ9D1J3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SarnpQ9D1J3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SarnpQ9D1J3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SarnpQ9D1J3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SarnpQ9D1J3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SarnpQ9D1J3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SarnpQ9D1J3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SarnpQ9D1J3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SarnpQ9D1J3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SarnpQ9D1J3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SarnpQ9D1J3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SarnpQ9D1J3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SarnpQ9D1J3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SarnpQ9D1J3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SarnpQ9D1J3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SarnpQ9D1J3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SarnpQ9D1J3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SarnpQ9D1J3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SarnpQ9D1J3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SarnpQ9D1J3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SarnpQ9D1J3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SarnpQ9D1J3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SarnpQ9D1J3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SarnpQ9D1J3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SarnpQ9D1J3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SarnpQ9D1J3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SarnpQ9D1J3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SarnpQ9D1J3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SarnpQ9D1J3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SarnpQ9D1J3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SarnpQ9D1J3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SarnpQ9D1J3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SarnpQ9D1J3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SarnpQ9D1J3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SarnpQ9D1J3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SarnpQ9D1J3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SarnpQ9D1J3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SarnpQ9D1J3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SarnpQ9D1J3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SarnpQ9D1J3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SarnpQ9D1J3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SarnpQ9D1J3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SarnpQ9D1J3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SarnpQ9D1J3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SarnpQ9D1J3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SarnpQ9D1J3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SarnpQ9D1J3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SarnpQ9D1J3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SarnpQ9D1J3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SarnpQ9D1J3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SarnpQ9D1J3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SarnpQ9D1J3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SarnpQ9D1J3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SarnpQ9D1J3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SarnpQ9D1J3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SarnpQ9D1J3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SarnpQ9D1J3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SarnpQ9D1J3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SarnpQ9D1J3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SarnpQ9D1J3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SarnpQ9D1J3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SarnpQ9D1J3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SarnpQ9D1J3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SarnpQ9D1J3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SarnpQ9D1J3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SarnpQ9D1J3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SarnpQ9D1J3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SarnpQ9D1J3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SarnpQ9D1J3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SarnpQ9D1J3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SarnpQ9D1J3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SarnpQ9D1J3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SarnpQ9D1J3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SarnpQ9D1J3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SarnpQ9D1J3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SarnpQ9D1J3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SarnpQ9D1J3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SarnpQ9D1J3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SarnpQ9D1J3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SarnpQ9D1J3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SarnpQ9D1J3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SarnpQ9D1J3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms