Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9D1F3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9D1F3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9D1F3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9D1F3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9D1F3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9D1F3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9D1F3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9D1F3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9D1F3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9D1F3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9D1F3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9D1F3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9D1F3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9D1F3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9D1F3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9D1F3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9D1F3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9D1F3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9D1F3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9D1F3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9D1F3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9D1F3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9D1F3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9D1F3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9D1F3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9D1F3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9D1F3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9D1F3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9D1F3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9D1F3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9D1F3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9D1F3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9D1F3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9D1F3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9D1F3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9D1F3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9D1F3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Q9D1F3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Q9D1F3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Q9D1F3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9D1F3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9D1F3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9D1F3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9D1F3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9D1F3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9D1F3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9D1F3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9D1F3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9D1F3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9D1F3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9D1F3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9D1F3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9D1F3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9D1F3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9D1F3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9D1F3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9D1F3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9D1F3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9D1F3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9D1F3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9D1F3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9D1F3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9D1F3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9D1F3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9D1F3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9D1F3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9D1F3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9D1F3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9D1F3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9D1F3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9D1F3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9D1F3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9D1F3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9D1F3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9D1F3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9D1F3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9D1F3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9D1F3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9D1F3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9D1F3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9D1F3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9D1F3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9D1F3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9D1F3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9D1F3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9D1F3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9D1F3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9D1F3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9D1F3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9D1F3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9D1F3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9D1F3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9D1F3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9D1F3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9D1F3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q9D1F3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q9D1F3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q9D1F3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Q9D1F3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms