Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZU3

Mtrex, Exosome RNA helicase MTR4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MtrexQ9CZU3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MtrexQ9CZU3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MtrexQ9CZU3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MtrexQ9CZU3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MtrexQ9CZU3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MtrexQ9CZU3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MtrexQ9CZU3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MtrexQ9CZU3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MtrexQ9CZU3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MtrexQ9CZU3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MtrexQ9CZU3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MtrexQ9CZU3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MtrexQ9CZU3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MtrexQ9CZU3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MtrexQ9CZU3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MtrexQ9CZU3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MtrexQ9CZU3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MtrexQ9CZU3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MtrexQ9CZU3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MtrexQ9CZU3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MtrexQ9CZU3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MtrexQ9CZU3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MtrexQ9CZU3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MtrexQ9CZU3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MtrexQ9CZU3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MtrexQ9CZU3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MtrexQ9CZU3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MtrexQ9CZU3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MtrexQ9CZU3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MtrexQ9CZU3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MtrexQ9CZU3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MtrexQ9CZU3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MtrexQ9CZU3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MtrexQ9CZU3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MtrexQ9CZU3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MtrexQ9CZU3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MtrexQ9CZU3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MtrexQ9CZU3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MtrexQ9CZU3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MtrexQ9CZU3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MtrexQ9CZU3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MtrexQ9CZU3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MtrexQ9CZU3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MtrexQ9CZU3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MtrexQ9CZU3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MtrexQ9CZU3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MtrexQ9CZU3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MtrexQ9CZU3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MtrexQ9CZU3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MtrexQ9CZU3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MtrexQ9CZU3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MtrexQ9CZU3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MtrexQ9CZU3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MtrexQ9CZU3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MtrexQ9CZU3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MtrexQ9CZU3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MtrexQ9CZU3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MtrexQ9CZU3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MtrexQ9CZU3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MtrexQ9CZU3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MtrexQ9CZU3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MtrexQ9CZU3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MtrexQ9CZU3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MtrexQ9CZU3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MtrexQ9CZU3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MtrexQ9CZU3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MtrexQ9CZU3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MtrexQ9CZU3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MtrexQ9CZU3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MtrexQ9CZU3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MtrexQ9CZU3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MtrexQ9CZU3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MtrexQ9CZU3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MtrexQ9CZU3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MtrexQ9CZU3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MtrexQ9CZU3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MtrexQ9CZU3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MtrexQ9CZU3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MtrexQ9CZU3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MtrexQ9CZU3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MtrexQ9CZU3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MtrexQ9CZU3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MtrexQ9CZU3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MtrexQ9CZU3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MtrexQ9CZU3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MtrexQ9CZU3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MtrexQ9CZU3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MtrexQ9CZU3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MtrexQ9CZU3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MtrexQ9CZU3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MtrexQ9CZU3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MtrexQ9CZU3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MtrexQ9CZU3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MtrexQ9CZU3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MtrexQ9CZU3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
MtrexQ9CZU3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MtrexQ9CZU3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MtrexQ9CZU3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MtrexQ9CZU3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MtrexQ9CZU3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms