Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Shisa9Q9CZN4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shisa9Q9CZN4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Shisa9Q9CZN4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shisa9Q9CZN4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shisa9Q9CZN4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shisa9Q9CZN4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shisa9Q9CZN4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Shisa9Q9CZN4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shisa9Q9CZN4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shisa9Q9CZN4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shisa9Q9CZN4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shisa9Q9CZN4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Shisa9Q9CZN4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shisa9Q9CZN4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shisa9Q9CZN4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shisa9Q9CZN4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Shisa9Q9CZN4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shisa9Q9CZN4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shisa9Q9CZN4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shisa9Q9CZN4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shisa9Q9CZN4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shisa9Q9CZN4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shisa9Q9CZN4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shisa9Q9CZN4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shisa9Q9CZN4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shisa9Q9CZN4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shisa9Q9CZN4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shisa9Q9CZN4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shisa9Q9CZN4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shisa9Q9CZN4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Shisa9Q9CZN4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shisa9Q9CZN4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Shisa9Q9CZN4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shisa9Q9CZN4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shisa9Q9CZN4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shisa9Q9CZN4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shisa9Q9CZN4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shisa9Q9CZN4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Shisa9Q9CZN4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Shisa9Q9CZN4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Shisa9Q9CZN4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Shisa9Q9CZN4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Shisa9Q9CZN4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Shisa9Q9CZN4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Shisa9Q9CZN4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Shisa9Q9CZN4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shisa9Q9CZN4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shisa9Q9CZN4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shisa9Q9CZN4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shisa9Q9CZN4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shisa9Q9CZN4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shisa9Q9CZN4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shisa9Q9CZN4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shisa9Q9CZN4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shisa9Q9CZN4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shisa9Q9CZN4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shisa9Q9CZN4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shisa9Q9CZN4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shisa9Q9CZN4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shisa9Q9CZN4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shisa9Q9CZN4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shisa9Q9CZN4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shisa9Q9CZN4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Shisa9Q9CZN4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Shisa9Q9CZN4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Shisa9Q9CZN4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Shisa9Q9CZN4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shisa9Q9CZN4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Shisa9Q9CZN4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shisa9Q9CZN4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shisa9Q9CZN4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shisa9Q9CZN4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Shisa9Q9CZN4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shisa9Q9CZN4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shisa9Q9CZN4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shisa9Q9CZN4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Shisa9Q9CZN4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shisa9Q9CZN4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shisa9Q9CZN4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shisa9Q9CZN4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Shisa9Q9CZN4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shisa9Q9CZN4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Shisa9Q9CZN4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shisa9Q9CZN4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shisa9Q9CZN4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shisa9Q9CZN4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms