Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nde1Q9CZA6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nde1Q9CZA6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nde1Q9CZA6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nde1Q9CZA6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nde1Q9CZA6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nde1Q9CZA6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nde1Q9CZA6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nde1Q9CZA6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nde1Q9CZA6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nde1Q9CZA6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nde1Q9CZA6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nde1Q9CZA6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nde1Q9CZA6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nde1Q9CZA6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nde1Q9CZA6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nde1Q9CZA6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nde1Q9CZA6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nde1Q9CZA6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nde1Q9CZA6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nde1Q9CZA6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nde1Q9CZA6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nde1Q9CZA6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nde1Q9CZA6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nde1Q9CZA6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Nde1Q9CZA6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Nde1Q9CZA6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nde1Q9CZA6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nde1Q9CZA6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nde1Q9CZA6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nde1Q9CZA6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Nde1Q9CZA6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nde1Q9CZA6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nde1Q9CZA6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nde1Q9CZA6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nde1Q9CZA6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nde1Q9CZA6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nde1Q9CZA6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nde1Q9CZA6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nde1Q9CZA6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Nde1Q9CZA6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nde1Q9CZA6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nde1Q9CZA6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nde1Q9CZA6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nde1Q9CZA6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nde1Q9CZA6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nde1Q9CZA6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nde1Q9CZA6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nde1Q9CZA6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nde1Q9CZA6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Nde1Q9CZA6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nde1Q9CZA6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nde1Q9CZA6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nde1Q9CZA6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nde1Q9CZA6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Nde1Q9CZA6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Nde1Q9CZA6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nde1Q9CZA6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nde1Q9CZA6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nde1Q9CZA6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nde1Q9CZA6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nde1Q9CZA6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nde1Q9CZA6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nde1Q9CZA6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nde1Q9CZA6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nde1Q9CZA6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nde1Q9CZA6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nde1Q9CZA6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nde1Q9CZA6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nde1Q9CZA6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nde1Q9CZA6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nde1Q9CZA6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nde1Q9CZA6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nde1Q9CZA6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nde1Q9CZA6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nde1Q9CZA6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nde1Q9CZA6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nde1Q9CZA6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nde1Q9CZA6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nde1Q9CZA6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nde1Q9CZA6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nde1Q9CZA6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Nde1Q9CZA6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Nde1Q9CZA6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nde1Q9CZA6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nde1Q9CZA6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nde1Q9CZA6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nde1Q9CZA6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nde1Q9CZA6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Nde1Q9CZA6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nde1Q9CZA6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nde1Q9CZA6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nde1Q9CZA6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Nde1Q9CZA6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nde1Q9CZA6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nde1Q9CZA6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nde1Q9CZA6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nde1Q9CZA6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nde1Q9CZA6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nde1Q9CZA6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms