Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ49

Klhl35, Kelch-like protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl35Q9CZ49 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhl35Q9CZ49 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhl35Q9CZ49 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhl35Q9CZ49 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhl35Q9CZ49 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhl35Q9CZ49 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhl35Q9CZ49 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhl35Q9CZ49 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhl35Q9CZ49 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhl35Q9CZ49 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl35Q9CZ49 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl35Q9CZ49 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl35Q9CZ49 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl35Q9CZ49 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl35Q9CZ49 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl35Q9CZ49 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl35Q9CZ49 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl35Q9CZ49 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl35Q9CZ49 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl35Q9CZ49 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl35Q9CZ49 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl35Q9CZ49 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl35Q9CZ49 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl35Q9CZ49 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl35Q9CZ49 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl35Q9CZ49 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl35Q9CZ49 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl35Q9CZ49 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl35Q9CZ49 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl35Q9CZ49 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl35Q9CZ49 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl35Q9CZ49 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl35Q9CZ49 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl35Q9CZ49 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl35Q9CZ49 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhl35Q9CZ49 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhl35Q9CZ49 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhl35Q9CZ49 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhl35Q9CZ49 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhl35Q9CZ49 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhl35Q9CZ49 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhl35Q9CZ49 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhl35Q9CZ49 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhl35Q9CZ49 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Klhl35Q9CZ49 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Klhl35Q9CZ49 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klhl35Q9CZ49 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klhl35Q9CZ49 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl35Q9CZ49 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl35Q9CZ49 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl35Q9CZ49 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl35Q9CZ49 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl35Q9CZ49 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl35Q9CZ49 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl35Q9CZ49 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl35Q9CZ49 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl35Q9CZ49 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl35Q9CZ49 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl35Q9CZ49 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhl35Q9CZ49 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhl35Q9CZ49 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhl35Q9CZ49 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhl35Q9CZ49 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhl35Q9CZ49 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhl35Q9CZ49 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhl35Q9CZ49 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhl35Q9CZ49 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhl35Q9CZ49 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhl35Q9CZ49 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhl35Q9CZ49 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhl35Q9CZ49 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhl35Q9CZ49 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhl35Q9CZ49 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhl35Q9CZ49 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhl35Q9CZ49 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhl35Q9CZ49 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhl35Q9CZ49 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhl35Q9CZ49 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhl35Q9CZ49 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhl35Q9CZ49 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhl35Q9CZ49 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhl35Q9CZ49 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhl35Q9CZ49 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhl35Q9CZ49 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhl35Q9CZ49 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhl35Q9CZ49 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhl35Q9CZ49 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klhl35Q9CZ49 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klhl35Q9CZ49 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klhl35Q9CZ49 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klhl35Q9CZ49 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klhl35Q9CZ49 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klhl35Q9CZ49 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klhl35Q9CZ49 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klhl35Q9CZ49 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Klhl35Q9CZ49 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klhl35Q9CZ49 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klhl35Q9CZ49 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klhl35Q9CZ49 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klhl35Q9CZ49 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms