Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXB8

Alpk1, Alpha-protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alpk1Q9CXB8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Alpk1Q9CXB8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Alpk1Q9CXB8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Alpk1Q9CXB8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Alpk1Q9CXB8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Alpk1Q9CXB8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Alpk1Q9CXB8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Alpk1Q9CXB8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Alpk1Q9CXB8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Alpk1Q9CXB8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Alpk1Q9CXB8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Alpk1Q9CXB8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Alpk1Q9CXB8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Alpk1Q9CXB8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Alpk1Q9CXB8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Alpk1Q9CXB8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Alpk1Q9CXB8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Alpk1Q9CXB8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Alpk1Q9CXB8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Alpk1Q9CXB8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Alpk1Q9CXB8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Alpk1Q9CXB8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Alpk1Q9CXB8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Alpk1Q9CXB8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Alpk1Q9CXB8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Alpk1Q9CXB8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Alpk1Q9CXB8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Alpk1Q9CXB8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Alpk1Q9CXB8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Alpk1Q9CXB8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Alpk1Q9CXB8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Alpk1Q9CXB8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Alpk1Q9CXB8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Alpk1Q9CXB8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Alpk1Q9CXB8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Alpk1Q9CXB8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Alpk1Q9CXB8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Alpk1Q9CXB8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Alpk1Q9CXB8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Alpk1Q9CXB8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Alpk1Q9CXB8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Alpk1Q9CXB8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Alpk1Q9CXB8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Alpk1Q9CXB8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Alpk1Q9CXB8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Alpk1Q9CXB8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Alpk1Q9CXB8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Alpk1Q9CXB8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Alpk1Q9CXB8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Alpk1Q9CXB8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Alpk1Q9CXB8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Alpk1Q9CXB8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Alpk1Q9CXB8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Alpk1Q9CXB8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Alpk1Q9CXB8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Alpk1Q9CXB8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Alpk1Q9CXB8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Alpk1Q9CXB8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Alpk1Q9CXB8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Alpk1Q9CXB8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Alpk1Q9CXB8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Alpk1Q9CXB8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Alpk1Q9CXB8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Alpk1Q9CXB8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Alpk1Q9CXB8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Alpk1Q9CXB8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Alpk1Q9CXB8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Alpk1Q9CXB8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Alpk1Q9CXB8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Alpk1Q9CXB8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Alpk1Q9CXB8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Alpk1Q9CXB8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Alpk1Q9CXB8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Alpk1Q9CXB8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Alpk1Q9CXB8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Alpk1Q9CXB8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Alpk1Q9CXB8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Alpk1Q9CXB8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Alpk1Q9CXB8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Alpk1Q9CXB8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Alpk1Q9CXB8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Alpk1Q9CXB8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Alpk1Q9CXB8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Alpk1Q9CXB8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Alpk1Q9CXB8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Alpk1Q9CXB8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Alpk1Q9CXB8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Alpk1Q9CXB8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Alpk1Q9CXB8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Alpk1Q9CXB8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Alpk1Q9CXB8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Alpk1Q9CXB8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Alpk1Q9CXB8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Alpk1Q9CXB8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Alpk1Q9CXB8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Alpk1Q9CXB8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Alpk1Q9CXB8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Alpk1Q9CXB8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Alpk1Q9CXB8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Alpk1Q9CXB8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms