Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sft2d3Q9CSV6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sft2d3Q9CSV6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sft2d3Q9CSV6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sft2d3Q9CSV6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sft2d3Q9CSV6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sft2d3Q9CSV6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sft2d3Q9CSV6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sft2d3Q9CSV6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sft2d3Q9CSV6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sft2d3Q9CSV6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sft2d3Q9CSV6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sft2d3Q9CSV6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sft2d3Q9CSV6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sft2d3Q9CSV6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sft2d3Q9CSV6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sft2d3Q9CSV6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sft2d3Q9CSV6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sft2d3Q9CSV6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sft2d3Q9CSV6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sft2d3Q9CSV6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sft2d3Q9CSV6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Sft2d3Q9CSV6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sft2d3Q9CSV6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sft2d3Q9CSV6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sft2d3Q9CSV6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sft2d3Q9CSV6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sft2d3Q9CSV6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sft2d3Q9CSV6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sft2d3Q9CSV6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sft2d3Q9CSV6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sft2d3Q9CSV6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sft2d3Q9CSV6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sft2d3Q9CSV6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sft2d3Q9CSV6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sft2d3Q9CSV6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sft2d3Q9CSV6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sft2d3Q9CSV6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sft2d3Q9CSV6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sft2d3Q9CSV6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sft2d3Q9CSV6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sft2d3Q9CSV6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sft2d3Q9CSV6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sft2d3Q9CSV6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sft2d3Q9CSV6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sft2d3Q9CSV6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sft2d3Q9CSV6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sft2d3Q9CSV6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sft2d3Q9CSV6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sft2d3Q9CSV6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sft2d3Q9CSV6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sft2d3Q9CSV6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sft2d3Q9CSV6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sft2d3Q9CSV6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sft2d3Q9CSV6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sft2d3Q9CSV6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sft2d3Q9CSV6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sft2d3Q9CSV6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Sft2d3Q9CSV6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sft2d3Q9CSV6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sft2d3Q9CSV6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sft2d3Q9CSV6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sft2d3Q9CSV6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sft2d3Q9CSV6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Sft2d3Q9CSV6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sft2d3Q9CSV6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sft2d3Q9CSV6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sft2d3Q9CSV6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sft2d3Q9CSV6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sft2d3Q9CSV6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sft2d3Q9CSV6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sft2d3Q9CSV6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sft2d3Q9CSV6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sft2d3Q9CSV6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sft2d3Q9CSV6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sft2d3Q9CSV6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sft2d3Q9CSV6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Sft2d3Q9CSV6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sft2d3Q9CSV6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sft2d3Q9CSV6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sft2d3Q9CSV6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sft2d3Q9CSV6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sft2d3Q9CSV6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sft2d3Q9CSV6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sft2d3Q9CSV6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sft2d3Q9CSV6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sft2d3Q9CSV6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sft2d3Q9CSV6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sft2d3Q9CSV6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sft2d3Q9CSV6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sft2d3Q9CSV6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sft2d3Q9CSV6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sft2d3Q9CSV6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sft2d3Q9CSV6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sft2d3Q9CSV6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sft2d3Q9CSV6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sft2d3Q9CSV6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sft2d3Q9CSV6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Sft2d3Q9CSV6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sft2d3Q9CSV6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms