Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH3

Ndufb5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb5Q9CQH3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufb5Q9CQH3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufb5Q9CQH3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ndufb5Q9CQH3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ndufb5Q9CQH3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ndufb5Q9CQH3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ndufb5Q9CQH3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ndufb5Q9CQH3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ndufb5Q9CQH3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ndufb5Q9CQH3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ndufb5Q9CQH3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndufb5Q9CQH3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndufb5Q9CQH3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndufb5Q9CQH3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndufb5Q9CQH3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndufb5Q9CQH3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndufb5Q9CQH3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndufb5Q9CQH3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndufb5Q9CQH3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufb5Q9CQH3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufb5Q9CQH3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufb5Q9CQH3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufb5Q9CQH3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufb5Q9CQH3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufb5Q9CQH3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufb5Q9CQH3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufb5Q9CQH3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndufb5Q9CQH3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufb5Q9CQH3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufb5Q9CQH3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufb5Q9CQH3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufb5Q9CQH3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufb5Q9CQH3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufb5Q9CQH3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ndufb5Q9CQH3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndufb5Q9CQH3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndufb5Q9CQH3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndufb5Q9CQH3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndufb5Q9CQH3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndufb5Q9CQH3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ndufb5Q9CQH3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufb5Q9CQH3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufb5Q9CQH3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufb5Q9CQH3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufb5Q9CQH3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufb5Q9CQH3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufb5Q9CQH3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufb5Q9CQH3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufb5Q9CQH3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufb5Q9CQH3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufb5Q9CQH3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufb5Q9CQH3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufb5Q9CQH3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndufb5Q9CQH3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndufb5Q9CQH3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndufb5Q9CQH3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndufb5Q9CQH3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndufb5Q9CQH3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndufb5Q9CQH3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndufb5Q9CQH3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndufb5Q9CQH3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndufb5Q9CQH3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndufb5Q9CQH3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndufb5Q9CQH3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ndufb5Q9CQH3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ndufb5Q9CQH3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufb5Q9CQH3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufb5Q9CQH3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufb5Q9CQH3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufb5Q9CQH3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufb5Q9CQH3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndufb5Q9CQH3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndufb5Q9CQH3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndufb5Q9CQH3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndufb5Q9CQH3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndufb5Q9CQH3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndufb5Q9CQH3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndufb5Q9CQH3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndufb5Q9CQH3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndufb5Q9CQH3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndufb5Q9CQH3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndufb5Q9CQH3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndufb5Q9CQH3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndufb5Q9CQH3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufb5Q9CQH3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufb5Q9CQH3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufb5Q9CQH3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufb5Q9CQH3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufb5Q9CQH3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufb5Q9CQH3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufb5Q9CQH3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndufb5Q9CQH3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufb5Q9CQH3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndufb5Q9CQH3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndufb5Q9CQH3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndufb5Q9CQH3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndufb5Q9CQH3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndufb5Q9CQH3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndufb5Q9CQH3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndufb5Q9CQH3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms