Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bhlhe41Q99PV5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Bhlhe41Q99PV5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bhlhe41Q99PV5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bhlhe41Q99PV5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bhlhe41Q99PV5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bhlhe41Q99PV5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Bhlhe41Q99PV5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Bhlhe41Q99PV5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Bhlhe41Q99PV5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bhlhe41Q99PV5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bhlhe41Q99PV5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bhlhe41Q99PV5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bhlhe41Q99PV5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bhlhe41Q99PV5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bhlhe41Q99PV5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bhlhe41Q99PV5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bhlhe41Q99PV5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bhlhe41Q99PV5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bhlhe41Q99PV5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bhlhe41Q99PV5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Bhlhe41Q99PV5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlhe41Q99PV5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlhe41Q99PV5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlhe41Q99PV5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlhe41Q99PV5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlhe41Q99PV5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlhe41Q99PV5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlhe41Q99PV5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlhe41Q99PV5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlhe41Q99PV5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlhe41Q99PV5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlhe41Q99PV5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bhlhe41Q99PV5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bhlhe41Q99PV5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bhlhe41Q99PV5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bhlhe41Q99PV5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bhlhe41Q99PV5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bhlhe41Q99PV5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bhlhe41Q99PV5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bhlhe41Q99PV5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bhlhe41Q99PV5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bhlhe41Q99PV5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Bhlhe41Q99PV5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bhlhe41Q99PV5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bhlhe41Q99PV5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bhlhe41Q99PV5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bhlhe41Q99PV5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bhlhe41Q99PV5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Bhlhe41Q99PV5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bhlhe41Q99PV5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bhlhe41Q99PV5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bhlhe41Q99PV5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bhlhe41Q99PV5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bhlhe41Q99PV5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bhlhe41Q99PV5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bhlhe41Q99PV5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bhlhe41Q99PV5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bhlhe41Q99PV5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bhlhe41Q99PV5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bhlhe41Q99PV5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bhlhe41Q99PV5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bhlhe41Q99PV5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bhlhe41Q99PV5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bhlhe41Q99PV5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bhlhe41Q99PV5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bhlhe41Q99PV5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bhlhe41Q99PV5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bhlhe41Q99PV5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bhlhe41Q99PV5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bhlhe41Q99PV5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bhlhe41Q99PV5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bhlhe41Q99PV5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bhlhe41Q99PV5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bhlhe41Q99PV5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bhlhe41Q99PV5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bhlhe41Q99PV5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bhlhe41Q99PV5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bhlhe41Q99PV5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bhlhe41Q99PV5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bhlhe41Q99PV5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bhlhe41Q99PV5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bhlhe41Q99PV5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bhlhe41Q99PV5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bhlhe41Q99PV5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bhlhe41Q99PV5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bhlhe41Q99PV5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bhlhe41Q99PV5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bhlhe41Q99PV5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bhlhe41Q99PV5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bhlhe41Q99PV5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bhlhe41Q99PV5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bhlhe41Q99PV5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bhlhe41Q99PV5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bhlhe41Q99PV5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bhlhe41Q99PV5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bhlhe41Q99PV5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bhlhe41Q99PV5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Bhlhe41Q99PV5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms