Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Prpf8Q99PV0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prpf8Q99PV0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Prpf8Q99PV0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prpf8Q99PV0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prpf8Q99PV0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prpf8Q99PV0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prpf8Q99PV0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prpf8Q99PV0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prpf8Q99PV0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Prpf8Q99PV0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prpf8Q99PV0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Prpf8Q99PV0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf8Q99PV0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf8Q99PV0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf8Q99PV0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf8Q99PV0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf8Q99PV0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf8Q99PV0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf8Q99PV0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf8Q99PV0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf8Q99PV0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Prpf8Q99PV0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf8Q99PV0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf8Q99PV0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf8Q99PV0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf8Q99PV0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf8Q99PV0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf8Q99PV0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf8Q99PV0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf8Q99PV0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf8Q99PV0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prpf8Q99PV0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf8Q99PV0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf8Q99PV0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf8Q99PV0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf8Q99PV0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf8Q99PV0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf8Q99PV0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf8Q99PV0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf8Q99PV0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf8Q99PV0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prpf8Q99PV0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf8Q99PV0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf8Q99PV0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf8Q99PV0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf8Q99PV0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf8Q99PV0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf8Q99PV0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf8Q99PV0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf8Q99PV0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf8Q99PV0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf8Q99PV0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prpf8Q99PV0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf8Q99PV0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf8Q99PV0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf8Q99PV0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf8Q99PV0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf8Q99PV0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prpf8Q99PV0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prpf8Q99PV0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prpf8Q99PV0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prpf8Q99PV0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf8Q99PV0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf8Q99PV0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf8Q99PV0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf8Q99PV0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf8Q99PV0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf8Q99PV0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf8Q99PV0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf8Q99PV0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf8Q99PV0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf8Q99PV0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf8Q99PV0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf8Q99PV0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf8Q99PV0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf8Q99PV0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf8Q99PV0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf8Q99PV0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf8Q99PV0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prpf8Q99PV0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf8Q99PV0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf8Q99PV0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf8Q99PV0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf8Q99PV0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf8Q99PV0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf8Q99PV0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf8Q99PV0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prpf8Q99PV0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf8Q99PV0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf8Q99PV0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf8Q99PV0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf8Q99PV0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf8Q99PV0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf8Q99PV0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf8Q99PV0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prpf8Q99PV0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf8Q99PV0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf8Q99PV0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Prpf8Q99PV0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms