Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim12aQ99PQ1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim12aQ99PQ1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim12aQ99PQ1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim12aQ99PQ1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Trim12aQ99PQ1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim12aQ99PQ1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Trim12aQ99PQ1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Trim12aQ99PQ1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim12aQ99PQ1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Trim12aQ99PQ1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Trim12aQ99PQ1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim12aQ99PQ1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim12aQ99PQ1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms