Protein–RNA interactions for Protein: Q99P51

Rassf3, Ras association domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf3Q99P51 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rassf3Q99P51 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rassf3Q99P51 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rassf3Q99P51 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rassf3Q99P51 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rassf3Q99P51 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rassf3Q99P51 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rassf3Q99P51 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rassf3Q99P51 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rassf3Q99P51 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rassf3Q99P51 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rassf3Q99P51 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rassf3Q99P51 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rassf3Q99P51 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rassf3Q99P51 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rassf3Q99P51 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rassf3Q99P51 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rassf3Q99P51 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rassf3Q99P51 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rassf3Q99P51 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rassf3Q99P51 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rassf3Q99P51 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rassf3Q99P51 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rassf3Q99P51 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rassf3Q99P51 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rassf3Q99P51 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rassf3Q99P51 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rassf3Q99P51 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rassf3Q99P51 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rassf3Q99P51 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rassf3Q99P51 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rassf3Q99P51 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rassf3Q99P51 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rassf3Q99P51 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rassf3Q99P51 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rassf3Q99P51 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rassf3Q99P51 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rassf3Q99P51 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rassf3Q99P51 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rassf3Q99P51 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rassf3Q99P51 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rassf3Q99P51 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rassf3Q99P51 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rassf3Q99P51 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rassf3Q99P51 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rassf3Q99P51 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rassf3Q99P51 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rassf3Q99P51 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rassf3Q99P51 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rassf3Q99P51 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rassf3Q99P51 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rassf3Q99P51 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rassf3Q99P51 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rassf3Q99P51 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rassf3Q99P51 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rassf3Q99P51 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rassf3Q99P51 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Rassf3Q99P51 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rassf3Q99P51 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rassf3Q99P51 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rassf3Q99P51 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rassf3Q99P51 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rassf3Q99P51 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rassf3Q99P51 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rassf3Q99P51 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rassf3Q99P51 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rassf3Q99P51 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rassf3Q99P51 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rassf3Q99P51 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rassf3Q99P51 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rassf3Q99P51 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rassf3Q99P51 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rassf3Q99P51 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rassf3Q99P51 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rassf3Q99P51 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rassf3Q99P51 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rassf3Q99P51 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rassf3Q99P51 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rassf3Q99P51 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rassf3Q99P51 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rassf3Q99P51 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rassf3Q99P51 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rassf3Q99P51 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rassf3Q99P51 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rassf3Q99P51 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rassf3Q99P51 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rassf3Q99P51 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rassf3Q99P51 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rassf3Q99P51 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rassf3Q99P51 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rassf3Q99P51 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rassf3Q99P51 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rassf3Q99P51 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rassf3Q99P51 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rassf3Q99P51 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rassf3Q99P51 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rassf3Q99P51 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rassf3Q99P51 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rassf3Q99P51 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rassf3Q99P51 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1255.4 ms