Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf2ird2Q99NI3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Gtf2ird2Q99NI3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2ird2Q99NI3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2ird2Q99NI3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2ird2Q99NI3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2ird2Q99NI3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2ird2Q99NI3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2ird2Q99NI3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2ird2Q99NI3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2ird2Q99NI3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2ird2Q99NI3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2ird2Q99NI3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2ird2Q99NI3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2ird2Q99NI3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2ird2Q99NI3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2ird2Q99NI3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2ird2Q99NI3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2ird2Q99NI3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2ird2Q99NI3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2ird2Q99NI3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2ird2Q99NI3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2ird2Q99NI3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2ird2Q99NI3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2ird2Q99NI3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2ird2Q99NI3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2ird2Q99NI3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2ird2Q99NI3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2ird2Q99NI3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2ird2Q99NI3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2ird2Q99NI3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2ird2Q99NI3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2ird2Q99NI3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2ird2Q99NI3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2ird2Q99NI3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2ird2Q99NI3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2ird2Q99NI3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2ird2Q99NI3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2ird2Q99NI3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2ird2Q99NI3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2ird2Q99NI3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2ird2Q99NI3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2ird2Q99NI3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2ird2Q99NI3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2ird2Q99NI3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2ird2Q99NI3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2ird2Q99NI3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gtf2ird2Q99NI3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf2ird2Q99NI3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf2ird2Q99NI3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf2ird2Q99NI3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf2ird2Q99NI3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2ird2Q99NI3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2ird2Q99NI3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2ird2Q99NI3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2ird2Q99NI3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2ird2Q99NI3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2ird2Q99NI3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2ird2Q99NI3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2ird2Q99NI3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2ird2Q99NI3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2ird2Q99NI3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2ird2Q99NI3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2ird2Q99NI3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2ird2Q99NI3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2ird2Q99NI3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2ird2Q99NI3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2ird2Q99NI3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2ird2Q99NI3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2ird2Q99NI3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2ird2Q99NI3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2ird2Q99NI3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2ird2Q99NI3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2ird2Q99NI3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2ird2Q99NI3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2ird2Q99NI3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2ird2Q99NI3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2ird2Q99NI3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2ird2Q99NI3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2ird2Q99NI3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2ird2Q99NI3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2ird2Q99NI3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2ird2Q99NI3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2ird2Q99NI3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2ird2Q99NI3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2ird2Q99NI3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2ird2Q99NI3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2ird2Q99NI3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2ird2Q99NI3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2ird2Q99NI3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2ird2Q99NI3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2ird2Q99NI3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2ird2Q99NI3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2ird2Q99NI3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2ird2Q99NI3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2ird2Q99NI3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2ird2Q99NI3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2ird2Q99NI3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gtf2ird2Q99NI3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms