Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Bco2Q99NF1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Bco2Q99NF1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Bco2Q99NF1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Bco2Q99NF1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Bco2Q99NF1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Bco2Q99NF1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Bco2Q99NF1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Bco2Q99NF1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Bco2Q99NF1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Bco2Q99NF1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Bco2Q99NF1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Bco2Q99NF1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Bco2Q99NF1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Bco2Q99NF1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Bco2Q99NF1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Bco2Q99NF1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Bco2Q99NF1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Bco2Q99NF1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Bco2Q99NF1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Bco2Q99NF1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Bco2Q99NF1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Bco2Q99NF1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bco2Q99NF1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Bco2Q99NF1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bco2Q99NF1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bco2Q99NF1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bco2Q99NF1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bco2Q99NF1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bco2Q99NF1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bco2Q99NF1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bco2Q99NF1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bco2Q99NF1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bco2Q99NF1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Bco2Q99NF1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Bco2Q99NF1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Bco2Q99NF1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Bco2Q99NF1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Bco2Q99NF1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Bco2Q99NF1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Bco2Q99NF1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Bco2Q99NF1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Bco2Q99NF1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Bco2Q99NF1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Bco2Q99NF1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bco2Q99NF1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Bco2Q99NF1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bco2Q99NF1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bco2Q99NF1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bco2Q99NF1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bco2Q99NF1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bco2Q99NF1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bco2Q99NF1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bco2Q99NF1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bco2Q99NF1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bco2Q99NF1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bco2Q99NF1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bco2Q99NF1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bco2Q99NF1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bco2Q99NF1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bco2Q99NF1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bco2Q99NF1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bco2Q99NF1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Bco2Q99NF1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Bco2Q99NF1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Bco2Q99NF1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Bco2Q99NF1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Bco2Q99NF1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Bco2Q99NF1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Bco2Q99NF1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Bco2Q99NF1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Bco2Q99NF1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Bco2Q99NF1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bco2Q99NF1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bco2Q99NF1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Bco2Q99NF1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bco2Q99NF1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bco2Q99NF1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bco2Q99NF1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bco2Q99NF1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bco2Q99NF1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bco2Q99NF1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bco2Q99NF1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bco2Q99NF1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bco2Q99NF1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bco2Q99NF1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bco2Q99NF1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bco2Q99NF1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bco2Q99NF1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bco2Q99NF1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bco2Q99NF1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bco2Q99NF1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bco2Q99NF1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bco2Q99NF1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bco2Q99NF1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Bco2Q99NF1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Bco2Q99NF1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Bco2Q99NF1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Bco2Q99NF1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bco2Q99NF1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
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