Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Pcgf6Q99NA9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Pcgf6Q99NA9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Pcgf6Q99NA9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Pcgf6Q99NA9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Pcgf6Q99NA9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Pcgf6Q99NA9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Pcgf6Q99NA9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Pcgf6Q99NA9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Pcgf6Q99NA9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Pcgf6Q99NA9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Pcgf6Q99NA9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Pcgf6Q99NA9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Pcgf6Q99NA9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Pcgf6Q99NA9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Pcgf6Q99NA9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Pcgf6Q99NA9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Pcgf6Q99NA9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Pcgf6Q99NA9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Pcgf6Q99NA9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Pcgf6Q99NA9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Pcgf6Q99NA9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Pcgf6Q99NA9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Pcgf6Q99NA9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Pcgf6Q99NA9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Pcgf6Q99NA9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Pcgf6Q99NA9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Pcgf6Q99NA9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Pcgf6Q99NA9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Pcgf6Q99NA9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Pcgf6Q99NA9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Pcgf6Q99NA9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Pcgf6Q99NA9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Pcgf6Q99NA9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Pcgf6Q99NA9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Pcgf6Q99NA9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Pcgf6Q99NA9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Pcgf6Q99NA9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Pcgf6Q99NA9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Pcgf6Q99NA9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Pcgf6Q99NA9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Pcgf6Q99NA9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Pcgf6Q99NA9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Pcgf6Q99NA9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Pcgf6Q99NA9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Pcgf6Q99NA9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Pcgf6Q99NA9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Pcgf6Q99NA9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Pcgf6Q99NA9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Pcgf6Q99NA9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Pcgf6Q99NA9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Pcgf6Q99NA9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Pcgf6Q99NA9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Pcgf6Q99NA9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Pcgf6Q99NA9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Pcgf6Q99NA9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Pcgf6Q99NA9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Pcgf6Q99NA9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Pcgf6Q99NA9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Pcgf6Q99NA9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Pcgf6Q99NA9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Pcgf6Q99NA9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Pcgf6Q99NA9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Pcgf6Q99NA9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Pcgf6Q99NA9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Pcgf6Q99NA9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Pcgf6Q99NA9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Pcgf6Q99NA9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Pcgf6Q99NA9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Pcgf6Q99NA9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Pcgf6Q99NA9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Pcgf6Q99NA9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Pcgf6Q99NA9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Pcgf6Q99NA9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Pcgf6Q99NA9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Pcgf6Q99NA9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Pcgf6Q99NA9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Pcgf6Q99NA9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Pcgf6Q99NA9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Pcgf6Q99NA9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Pcgf6Q99NA9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Pcgf6Q99NA9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Pcgf6Q99NA9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Pcgf6Q99NA9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Pcgf6Q99NA9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Pcgf6Q99NA9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Pcgf6Q99NA9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Pcgf6Q99NA9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Pcgf6Q99NA9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Pcgf6Q99NA9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Pcgf6Q99NA9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Pcgf6Q99NA9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Pcgf6Q99NA9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Pcgf6Q99NA9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Pcgf6Q99NA9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Pcgf6Q99NA9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Pcgf6Q99NA9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Pcgf6Q99NA9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Pcgf6Q99NA9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Pcgf6Q99NA9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms