Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtpbp4Q99ME9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gtpbp4Q99ME9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtpbp4Q99ME9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtpbp4Q99ME9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtpbp4Q99ME9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtpbp4Q99ME9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtpbp4Q99ME9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtpbp4Q99ME9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtpbp4Q99ME9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gtpbp4Q99ME9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtpbp4Q99ME9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtpbp4Q99ME9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtpbp4Q99ME9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtpbp4Q99ME9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtpbp4Q99ME9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtpbp4Q99ME9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtpbp4Q99ME9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtpbp4Q99ME9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gtpbp4Q99ME9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gtpbp4Q99ME9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gtpbp4Q99ME9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gtpbp4Q99ME9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gtpbp4Q99ME9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtpbp4Q99ME9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtpbp4Q99ME9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtpbp4Q99ME9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtpbp4Q99ME9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtpbp4Q99ME9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtpbp4Q99ME9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtpbp4Q99ME9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtpbp4Q99ME9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtpbp4Q99ME9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtpbp4Q99ME9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtpbp4Q99ME9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtpbp4Q99ME9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtpbp4Q99ME9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtpbp4Q99ME9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtpbp4Q99ME9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtpbp4Q99ME9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtpbp4Q99ME9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtpbp4Q99ME9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtpbp4Q99ME9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtpbp4Q99ME9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtpbp4Q99ME9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtpbp4Q99ME9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtpbp4Q99ME9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtpbp4Q99ME9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtpbp4Q99ME9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtpbp4Q99ME9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtpbp4Q99ME9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtpbp4Q99ME9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtpbp4Q99ME9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtpbp4Q99ME9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtpbp4Q99ME9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtpbp4Q99ME9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtpbp4Q99ME9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtpbp4Q99ME9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtpbp4Q99ME9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtpbp4Q99ME9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtpbp4Q99ME9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtpbp4Q99ME9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtpbp4Q99ME9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtpbp4Q99ME9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtpbp4Q99ME9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtpbp4Q99ME9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtpbp4Q99ME9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtpbp4Q99ME9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtpbp4Q99ME9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtpbp4Q99ME9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtpbp4Q99ME9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gtpbp4Q99ME9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gtpbp4Q99ME9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gtpbp4Q99ME9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtpbp4Q99ME9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtpbp4Q99ME9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtpbp4Q99ME9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtpbp4Q99ME9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtpbp4Q99ME9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtpbp4Q99ME9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtpbp4Q99ME9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtpbp4Q99ME9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtpbp4Q99ME9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtpbp4Q99ME9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtpbp4Q99ME9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtpbp4Q99ME9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtpbp4Q99ME9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtpbp4Q99ME9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtpbp4Q99ME9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtpbp4Q99ME9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtpbp4Q99ME9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtpbp4Q99ME9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtpbp4Q99ME9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtpbp4Q99ME9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtpbp4Q99ME9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtpbp4Q99ME9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtpbp4Q99ME9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtpbp4Q99ME9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtpbp4Q99ME9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtpbp4Q99ME9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms