Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Atp1b4Q99ME6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Atp1b4Q99ME6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Atp1b4Q99ME6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Atp1b4Q99ME6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Atp1b4Q99ME6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Atp1b4Q99ME6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Atp1b4Q99ME6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Atp1b4Q99ME6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Atp1b4Q99ME6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Atp1b4Q99ME6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Atp1b4Q99ME6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Atp1b4Q99ME6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Atp1b4Q99ME6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Atp1b4Q99ME6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Atp1b4Q99ME6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Atp1b4Q99ME6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Atp1b4Q99ME6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Atp1b4Q99ME6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Atp1b4Q99ME6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Atp1b4Q99ME6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Atp1b4Q99ME6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Atp1b4Q99ME6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Atp1b4Q99ME6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Atp1b4Q99ME6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Atp1b4Q99ME6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Atp1b4Q99ME6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Atp1b4Q99ME6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Atp1b4Q99ME6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Atp1b4Q99ME6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Atp1b4Q99ME6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Atp1b4Q99ME6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Atp1b4Q99ME6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Atp1b4Q99ME6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Atp1b4Q99ME6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Atp1b4Q99ME6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Atp1b4Q99ME6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Atp1b4Q99ME6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Atp1b4Q99ME6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Atp1b4Q99ME6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Atp1b4Q99ME6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Atp1b4Q99ME6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Atp1b4Q99ME6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Atp1b4Q99ME6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Atp1b4Q99ME6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Atp1b4Q99ME6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Atp1b4Q99ME6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Atp1b4Q99ME6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Atp1b4Q99ME6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Atp1b4Q99ME6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Atp1b4Q99ME6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Atp1b4Q99ME6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Atp1b4Q99ME6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Atp1b4Q99ME6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Atp1b4Q99ME6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Atp1b4Q99ME6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Atp1b4Q99ME6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Atp1b4Q99ME6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Atp1b4Q99ME6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Atp1b4Q99ME6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Atp1b4Q99ME6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Atp1b4Q99ME6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Atp1b4Q99ME6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Atp1b4Q99ME6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Atp1b4Q99ME6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Atp1b4Q99ME6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Atp1b4Q99ME6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Atp1b4Q99ME6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Atp1b4Q99ME6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Atp1b4Q99ME6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Atp1b4Q99ME6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Atp1b4Q99ME6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Atp1b4Q99ME6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Atp1b4Q99ME6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Atp1b4Q99ME6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Atp1b4Q99ME6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Atp1b4Q99ME6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Atp1b4Q99ME6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Atp1b4Q99ME6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Atp1b4Q99ME6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Atp1b4Q99ME6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Atp1b4Q99ME6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Atp1b4Q99ME6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Atp1b4Q99ME6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Atp1b4Q99ME6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Atp1b4Q99ME6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Atp1b4Q99ME6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Atp1b4Q99ME6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Atp1b4Q99ME6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Atp1b4Q99ME6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Atp1b4Q99ME6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Atp1b4Q99ME6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Atp1b4Q99ME6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Atp1b4Q99ME6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Atp1b4Q99ME6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Atp1b4Q99ME6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Atp1b4Q99ME6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Atp1b4Q99ME6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Atp1b4Q99ME6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Atp1b4Q99ME6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms