Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm2d1Q99MB3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms