Protein–RNA interactions for Protein: Q99M08

Uncharacterized protein C4orf3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99M08 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q99M08 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q99M08 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q99M08 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q99M08 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q99M08 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q99M08 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q99M08 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q99M08 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q99M08 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q99M08 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q99M08 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q99M08 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q99M08 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q99M08 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q99M08 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q99M08 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q99M08 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q99M08 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q99M08 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q99M08 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q99M08 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q99M08 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q99M08 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q99M08 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q99M08 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q99M08 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q99M08 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q99M08 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q99M08 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q99M08 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q99M08 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q99M08 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q99M08 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q99M08 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q99M08 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q99M08 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q99M08 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q99M08 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q99M08 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q99M08 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q99M08 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q99M08 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q99M08 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q99M08 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q99M08 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q99M08 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q99M08 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q99M08 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q99M08 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q99M08 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q99M08 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q99M08 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q99M08 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q99M08 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q99M08 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q99M08 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q99M08 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q99M08 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q99M08 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q99M08 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q99M08 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q99M08 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q99M08 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q99M08 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q99M08 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q99M08 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q99M08 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q99M08 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q99M08 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q99M08 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q99M08 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q99M08 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q99M08 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q99M08 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q99M08 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q99M08 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q99M08 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q99M08 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q99M08 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q99M08 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q99M08 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q99M08 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q99M08 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q99M08 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q99M08 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q99M08 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q99M08 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q99M08 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q99M08 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Q99M08 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Q99M08 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q99M08 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q99M08 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q99M08 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q99M08 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q99M08 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q99M08 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q99M08 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q99M08 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms