Protein–RNA interactions for Protein: Q99M02

March2, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH2, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
March2Q99M02 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
March2Q99M02 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
March2Q99M02 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
March2Q99M02 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
March2Q99M02 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
March2Q99M02 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
March2Q99M02 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
March2Q99M02 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
March2Q99M02 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
March2Q99M02 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
March2Q99M02 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
March2Q99M02 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
March2Q99M02 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.33■■□□□ 1
March2Q99M02 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
March2Q99M02 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
March2Q99M02 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
March2Q99M02 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
March2Q99M02 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
March2Q99M02 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.31■■□□□ 1
March2Q99M02 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
March2Q99M02 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
March2Q99M02 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
March2Q99M02 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
March2Q99M02 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
March2Q99M02 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
March2Q99M02 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
March2Q99M02 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
March2Q99M02 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
March2Q99M02 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
March2Q99M02 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
March2Q99M02 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
March2Q99M02 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
March2Q99M02 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.3■■□□□ 1
March2Q99M02 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
March2Q99M02 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
March2Q99M02 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
March2Q99M02 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
March2Q99M02 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
March2Q99M02 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.29■■□□□ 1
March2Q99M02 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
March2Q99M02 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
March2Q99M02 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
March2Q99M02 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
March2Q99M02 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
March2Q99M02 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
March2Q99M02 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
March2Q99M02 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.28■■□□□ 1
March2Q99M02 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
March2Q99M02 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
March2Q99M02 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
March2Q99M02 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
March2Q99M02 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
March2Q99M02 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
March2Q99M02 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
March2Q99M02 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.27■■□□□ 1
March2Q99M02 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
March2Q99M02 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
March2Q99M02 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
March2Q99M02 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
March2Q99M02 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
March2Q99M02 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
March2Q99M02 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
March2Q99M02 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
March2Q99M02 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
March2Q99M02 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
March2Q99M02 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
March2Q99M02 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
March2Q99M02 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
March2Q99M02 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
March2Q99M02 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
March2Q99M02 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
March2Q99M02 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
March2Q99M02 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
March2Q99M02 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
March2Q99M02 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
March2Q99M02 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
March2Q99M02 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
March2Q99M02 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
March2Q99M02 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
March2Q99M02 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
March2Q99M02 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
March2Q99M02 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
March2Q99M02 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
March2Q99M02 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
March2Q99M02 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
March2Q99M02 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
March2Q99M02 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
March2Q99M02 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
March2Q99M02 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
March2Q99M02 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
March2Q99M02 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
March2Q99M02 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
March2Q99M02 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
March2Q99M02 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
March2Q99M02 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
March2Q99M02 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
March2Q99M02 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
March2Q99M02 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
March2Q99M02 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
March2Q99M02 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms