Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gdpd3Q99LY2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gdpd3Q99LY2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gdpd3Q99LY2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gdpd3Q99LY2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gdpd3Q99LY2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gdpd3Q99LY2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gdpd3Q99LY2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gdpd3Q99LY2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gdpd3Q99LY2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gdpd3Q99LY2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gdpd3Q99LY2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gdpd3Q99LY2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gdpd3Q99LY2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gdpd3Q99LY2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gdpd3Q99LY2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gdpd3Q99LY2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gdpd3Q99LY2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gdpd3Q99LY2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gdpd3Q99LY2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gdpd3Q99LY2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gdpd3Q99LY2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gdpd3Q99LY2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gdpd3Q99LY2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gdpd3Q99LY2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gdpd3Q99LY2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gdpd3Q99LY2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gdpd3Q99LY2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gdpd3Q99LY2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gdpd3Q99LY2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gdpd3Q99LY2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gdpd3Q99LY2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gdpd3Q99LY2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gdpd3Q99LY2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 6.7 ms