Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM3

Smtnl1, Smoothelin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smtnl1Q99LM3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smtnl1Q99LM3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smtnl1Q99LM3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smtnl1Q99LM3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smtnl1Q99LM3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smtnl1Q99LM3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smtnl1Q99LM3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smtnl1Q99LM3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smtnl1Q99LM3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smtnl1Q99LM3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smtnl1Q99LM3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smtnl1Q99LM3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smtnl1Q99LM3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smtnl1Q99LM3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smtnl1Q99LM3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smtnl1Q99LM3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smtnl1Q99LM3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smtnl1Q99LM3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smtnl1Q99LM3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smtnl1Q99LM3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smtnl1Q99LM3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smtnl1Q99LM3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Smtnl1Q99LM3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smtnl1Q99LM3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smtnl1Q99LM3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smtnl1Q99LM3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smtnl1Q99LM3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smtnl1Q99LM3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smtnl1Q99LM3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smtnl1Q99LM3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smtnl1Q99LM3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smtnl1Q99LM3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smtnl1Q99LM3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smtnl1Q99LM3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smtnl1Q99LM3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smtnl1Q99LM3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smtnl1Q99LM3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Smtnl1Q99LM3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smtnl1Q99LM3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smtnl1Q99LM3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Smtnl1Q99LM3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smtnl1Q99LM3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smtnl1Q99LM3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smtnl1Q99LM3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smtnl1Q99LM3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Smtnl1Q99LM3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smtnl1Q99LM3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smtnl1Q99LM3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smtnl1Q99LM3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smtnl1Q99LM3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smtnl1Q99LM3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smtnl1Q99LM3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smtnl1Q99LM3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smtnl1Q99LM3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Smtnl1Q99LM3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smtnl1Q99LM3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smtnl1Q99LM3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smtnl1Q99LM3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smtnl1Q99LM3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smtnl1Q99LM3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smtnl1Q99LM3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smtnl1Q99LM3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smtnl1Q99LM3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smtnl1Q99LM3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smtnl1Q99LM3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smtnl1Q99LM3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smtnl1Q99LM3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Smtnl1Q99LM3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smtnl1Q99LM3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smtnl1Q99LM3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smtnl1Q99LM3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smtnl1Q99LM3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smtnl1Q99LM3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smtnl1Q99LM3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smtnl1Q99LM3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smtnl1Q99LM3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smtnl1Q99LM3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smtnl1Q99LM3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smtnl1Q99LM3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smtnl1Q99LM3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smtnl1Q99LM3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smtnl1Q99LM3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smtnl1Q99LM3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smtnl1Q99LM3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smtnl1Q99LM3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smtnl1Q99LM3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smtnl1Q99LM3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smtnl1Q99LM3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smtnl1Q99LM3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smtnl1Q99LM3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smtnl1Q99LM3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smtnl1Q99LM3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smtnl1Q99LM3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smtnl1Q99LM3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smtnl1Q99LM3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smtnl1Q99LM3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smtnl1Q99LM3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Smtnl1Q99LM3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Smtnl1Q99LM3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Smtnl1Q99LM3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms