Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TriobpQ99KW3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TriobpQ99KW3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TriobpQ99KW3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TriobpQ99KW3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TriobpQ99KW3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TriobpQ99KW3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TriobpQ99KW3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TriobpQ99KW3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TriobpQ99KW3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TriobpQ99KW3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TriobpQ99KW3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TriobpQ99KW3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TriobpQ99KW3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TriobpQ99KW3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TriobpQ99KW3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TriobpQ99KW3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TriobpQ99KW3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TriobpQ99KW3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TriobpQ99KW3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TriobpQ99KW3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TriobpQ99KW3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TriobpQ99KW3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TriobpQ99KW3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TriobpQ99KW3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TriobpQ99KW3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TriobpQ99KW3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TriobpQ99KW3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TriobpQ99KW3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TriobpQ99KW3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TriobpQ99KW3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TriobpQ99KW3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TriobpQ99KW3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TriobpQ99KW3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TriobpQ99KW3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TriobpQ99KW3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TriobpQ99KW3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TriobpQ99KW3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TriobpQ99KW3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TriobpQ99KW3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TriobpQ99KW3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TriobpQ99KW3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TriobpQ99KW3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TriobpQ99KW3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TriobpQ99KW3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TriobpQ99KW3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TriobpQ99KW3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TriobpQ99KW3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TriobpQ99KW3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TriobpQ99KW3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TriobpQ99KW3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TriobpQ99KW3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TriobpQ99KW3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TriobpQ99KW3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TriobpQ99KW3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TriobpQ99KW3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TriobpQ99KW3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TriobpQ99KW3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TriobpQ99KW3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TriobpQ99KW3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TriobpQ99KW3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TriobpQ99KW3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TriobpQ99KW3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TriobpQ99KW3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TriobpQ99KW3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TriobpQ99KW3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TriobpQ99KW3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TriobpQ99KW3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TriobpQ99KW3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TriobpQ99KW3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TriobpQ99KW3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TriobpQ99KW3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TriobpQ99KW3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TriobpQ99KW3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TriobpQ99KW3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TriobpQ99KW3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TriobpQ99KW3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TriobpQ99KW3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TriobpQ99KW3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TriobpQ99KW3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TriobpQ99KW3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TriobpQ99KW3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TriobpQ99KW3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TriobpQ99KW3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TriobpQ99KW3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TriobpQ99KW3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TriobpQ99KW3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TriobpQ99KW3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TriobpQ99KW3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TriobpQ99KW3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TriobpQ99KW3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TriobpQ99KW3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TriobpQ99KW3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TriobpQ99KW3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TriobpQ99KW3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TriobpQ99KW3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TriobpQ99KW3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TriobpQ99KW3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TriobpQ99KW3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TriobpQ99KW3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms