Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Reep3Q99KK1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Reep3Q99KK1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Reep3Q99KK1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Reep3Q99KK1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Reep3Q99KK1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Reep3Q99KK1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Reep3Q99KK1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Reep3Q99KK1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Reep3Q99KK1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Reep3Q99KK1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Reep3Q99KK1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Reep3Q99KK1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Reep3Q99KK1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Reep3Q99KK1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Reep3Q99KK1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Reep3Q99KK1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Reep3Q99KK1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Reep3Q99KK1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Reep3Q99KK1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Reep3Q99KK1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Reep3Q99KK1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Reep3Q99KK1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Reep3Q99KK1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Reep3Q99KK1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Reep3Q99KK1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Reep3Q99KK1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Reep3Q99KK1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Reep3Q99KK1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Reep3Q99KK1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Reep3Q99KK1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Reep3Q99KK1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Reep3Q99KK1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Reep3Q99KK1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Reep3Q99KK1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Reep3Q99KK1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Reep3Q99KK1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Reep3Q99KK1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Reep3Q99KK1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Reep3Q99KK1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Reep3Q99KK1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Reep3Q99KK1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Reep3Q99KK1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Reep3Q99KK1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Reep3Q99KK1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Reep3Q99KK1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Reep3Q99KK1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Reep3Q99KK1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Reep3Q99KK1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Reep3Q99KK1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Reep3Q99KK1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Reep3Q99KK1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Reep3Q99KK1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Reep3Q99KK1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Reep3Q99KK1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Reep3Q99KK1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Reep3Q99KK1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Reep3Q99KK1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Reep3Q99KK1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Reep3Q99KK1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Reep3Q99KK1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Reep3Q99KK1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Reep3Q99KK1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Reep3Q99KK1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Reep3Q99KK1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Reep3Q99KK1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Reep3Q99KK1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Reep3Q99KK1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Reep3Q99KK1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Reep3Q99KK1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Reep3Q99KK1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Reep3Q99KK1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Reep3Q99KK1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Reep3Q99KK1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Reep3Q99KK1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Reep3Q99KK1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Reep3Q99KK1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Reep3Q99KK1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Reep3Q99KK1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Reep3Q99KK1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Reep3Q99KK1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Reep3Q99KK1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Reep3Q99KK1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Reep3Q99KK1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Reep3Q99KK1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Reep3Q99KK1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Reep3Q99KK1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Reep3Q99KK1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Reep3Q99KK1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Reep3Q99KK1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Reep3Q99KK1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Reep3Q99KK1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Reep3Q99KK1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Reep3Q99KK1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Reep3Q99KK1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Reep3Q99KK1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Reep3Q99KK1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Reep3Q99KK1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Reep3Q99KK1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Reep3Q99KK1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms